Protein–RNA interactions for Protein: P21127

CDK11B, Cyclin-dependent kinase 11B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK11BP21127 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CDK11BP21127 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CDK11BP21127 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CDK11BP21127 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CDK11BP21127 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CDK11BP21127 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CDK11BP21127 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CDK11BP21127 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CDK11BP21127 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CDK11BP21127 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CDK11BP21127 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CDK11BP21127 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CDK11BP21127 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CDK11BP21127 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CDK11BP21127 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CDK11BP21127 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CDK11BP21127 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
CDK11BP21127 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CDK11BP21127 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
CDK11BP21127 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CDK11BP21127 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CDK11BP21127 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CDK11BP21127 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CDK11BP21127 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CDK11BP21127 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CDK11BP21127 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CDK11BP21127 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CDK11BP21127 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CDK11BP21127 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CDK11BP21127 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CDK11BP21127 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CDK11BP21127 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CDK11BP21127 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CDK11BP21127 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CDK11BP21127 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CDK11BP21127 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CDK11BP21127 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CDK11BP21127 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CDK11BP21127 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CDK11BP21127 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CDK11BP21127 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CDK11BP21127 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CDK11BP21127 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CDK11BP21127 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CDK11BP21127 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
CDK11BP21127 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CDK11BP21127 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CDK11BP21127 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CDK11BP21127 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CDK11BP21127 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CDK11BP21127 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CDK11BP21127 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CDK11BP21127 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CDK11BP21127 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CDK11BP21127 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CDK11BP21127 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CDK11BP21127 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CDK11BP21127 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CDK11BP21127 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CDK11BP21127 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CDK11BP21127 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CDK11BP21127 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CDK11BP21127 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CDK11BP21127 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CDK11BP21127 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CDK11BP21127 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CDK11BP21127 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CDK11BP21127 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CDK11BP21127 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CDK11BP21127 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
CDK11BP21127 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CDK11BP21127 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CDK11BP21127 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CDK11BP21127 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CDK11BP21127 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CDK11BP21127 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CDK11BP21127 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CDK11BP21127 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CDK11BP21127 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CDK11BP21127 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CDK11BP21127 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CDK11BP21127 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CDK11BP21127 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CDK11BP21127 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CDK11BP21127 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CDK11BP21127 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CDK11BP21127 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CDK11BP21127 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CDK11BP21127 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
CDK11BP21127 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CDK11BP21127 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CDK11BP21127 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CDK11BP21127 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CDK11BP21127 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CDK11BP21127 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CDK11BP21127 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CDK11BP21127 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CDK11BP21127 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CDK11BP21127 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CDK11BP21127 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms