Protein–RNA interactions for Protein: P20339

RAB5A, Ras-related protein Rab-5A, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5AP20339 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB5AP20339 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB5AP20339 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB5AP20339 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB5AP20339 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB5AP20339 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAB5AP20339 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB5AP20339 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB5AP20339 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB5AP20339 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB5AP20339 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB5AP20339 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB5AP20339 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB5AP20339 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAB5AP20339 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB5AP20339 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB5AP20339 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB5AP20339 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB5AP20339 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAB5AP20339 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAB5AP20339 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAB5AP20339 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RAB5AP20339 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RAB5AP20339 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
RAB5AP20339 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB5AP20339 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB5AP20339 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB5AP20339 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB5AP20339 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB5AP20339 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB5AP20339 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB5AP20339 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB5AP20339 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB5AP20339 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB5AP20339 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB5AP20339 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB5AP20339 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB5AP20339 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB5AP20339 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB5AP20339 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB5AP20339 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB5AP20339 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB5AP20339 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB5AP20339 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB5AP20339 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB5AP20339 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB5AP20339 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB5AP20339 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB5AP20339 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB5AP20339 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB5AP20339 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB5AP20339 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB5AP20339 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB5AP20339 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB5AP20339 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB5AP20339 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB5AP20339 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB5AP20339 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB5AP20339 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB5AP20339 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB5AP20339 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB5AP20339 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB5AP20339 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
RAB5AP20339 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB5AP20339 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB5AP20339 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB5AP20339 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB5AP20339 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB5AP20339 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB5AP20339 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB5AP20339 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB5AP20339 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB5AP20339 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB5AP20339 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB5AP20339 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB5AP20339 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB5AP20339 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB5AP20339 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB5AP20339 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB5AP20339 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB5AP20339 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB5AP20339 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB5AP20339 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB5AP20339 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB5AP20339 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB5AP20339 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB5AP20339 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB5AP20339 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB5AP20339 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB5AP20339 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB5AP20339 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB5AP20339 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB5AP20339 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB5AP20339 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB5AP20339 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB5AP20339 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RAB5AP20339 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RAB5AP20339 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RAB5AP20339 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB5AP20339 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms