Protein–RNA interactions for Protein: P15863

PAX1, Paired box protein Pax-1, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX1P15863 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PAX1P15863 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PAX1P15863 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PAX1P15863 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PAX1P15863 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PAX1P15863 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PAX1P15863 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PAX1P15863 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PAX1P15863 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PAX1P15863 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PAX1P15863 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PAX1P15863 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PAX1P15863 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PAX1P15863 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PAX1P15863 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PAX1P15863 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PAX1P15863 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PAX1P15863 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PAX1P15863 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PAX1P15863 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PAX1P15863 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PAX1P15863 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PAX1P15863 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PAX1P15863 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PAX1P15863 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PAX1P15863 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PAX1P15863 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PAX1P15863 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PAX1P15863 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PAX1P15863 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PAX1P15863 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PAX1P15863 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PAX1P15863 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PAX1P15863 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PAX1P15863 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PAX1P15863 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAX1P15863 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAX1P15863 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PAX1P15863 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PAX1P15863 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PAX1P15863 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PAX1P15863 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PAX1P15863 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PAX1P15863 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PAX1P15863 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PAX1P15863 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PAX1P15863 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PAX1P15863 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PAX1P15863 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PAX1P15863 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PAX1P15863 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PAX1P15863 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PAX1P15863 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PAX1P15863 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PAX1P15863 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PAX1P15863 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PAX1P15863 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PAX1P15863 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PAX1P15863 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PAX1P15863 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PAX1P15863 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PAX1P15863 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PAX1P15863 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PAX1P15863 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PAX1P15863 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PAX1P15863 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PAX1P15863 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PAX1P15863 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PAX1P15863 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PAX1P15863 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PAX1P15863 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PAX1P15863 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PAX1P15863 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PAX1P15863 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PAX1P15863 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PAX1P15863 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PAX1P15863 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PAX1P15863 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PAX1P15863 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PAX1P15863 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PAX1P15863 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PAX1P15863 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PAX1P15863 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PAX1P15863 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PAX1P15863 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PAX1P15863 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PAX1P15863 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PAX1P15863 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PAX1P15863 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PAX1P15863 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PAX1P15863 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PAX1P15863 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PAX1P15863 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PAX1P15863 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PAX1P15863 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PAX1P15863 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PAX1P15863 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PAX1P15863 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PAX1P15863 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PAX1P15863 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms