Protein–RNA interactions for Protein: P13727

PRG2, Bone marrow proteoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG2P13727 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRG2P13727 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRG2P13727 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRG2P13727 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRG2P13727 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRG2P13727 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRG2P13727 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRG2P13727 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRG2P13727 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRG2P13727 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRG2P13727 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRG2P13727 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRG2P13727 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRG2P13727 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRG2P13727 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PRG2P13727 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRG2P13727 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRG2P13727 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRG2P13727 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRG2P13727 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRG2P13727 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PRG2P13727 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRG2P13727 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRG2P13727 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRG2P13727 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRG2P13727 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRG2P13727 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
PRG2P13727 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRG2P13727 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRG2P13727 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRG2P13727 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PRG2P13727 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRG2P13727 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRG2P13727 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PRG2P13727 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRG2P13727 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRG2P13727 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRG2P13727 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRG2P13727 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRG2P13727 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRG2P13727 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRG2P13727 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRG2P13727 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRG2P13727 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRG2P13727 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRG2P13727 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRG2P13727 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRG2P13727 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRG2P13727 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRG2P13727 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRG2P13727 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRG2P13727 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRG2P13727 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PRG2P13727 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRG2P13727 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRG2P13727 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRG2P13727 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRG2P13727 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRG2P13727 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRG2P13727 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRG2P13727 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRG2P13727 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRG2P13727 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRG2P13727 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRG2P13727 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRG2P13727 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRG2P13727 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRG2P13727 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRG2P13727 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PRG2P13727 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRG2P13727 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRG2P13727 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PRG2P13727 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRG2P13727 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRG2P13727 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRG2P13727 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRG2P13727 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRG2P13727 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRG2P13727 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRG2P13727 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRG2P13727 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRG2P13727 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRG2P13727 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRG2P13727 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRG2P13727 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRG2P13727 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRG2P13727 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRG2P13727 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRG2P13727 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRG2P13727 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRG2P13727 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRG2P13727 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRG2P13727 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PRG2P13727 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRG2P13727 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRG2P13727 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRG2P13727 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRG2P13727 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRG2P13727 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRG2P13727 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms