Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
RLBP1P12271 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
RLBP1P12271 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
RLBP1P12271 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
RLBP1P12271 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
RLBP1P12271 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
RLBP1P12271 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
RLBP1P12271 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
RLBP1P12271 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
RLBP1P12271 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
RLBP1P12271 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
RLBP1P12271 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC33.1■■■□□ 2.89
RLBP1P12271 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
RLBP1P12271 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
RLBP1P12271 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
RLBP1P12271 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
RLBP1P12271 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
RLBP1P12271 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
RLBP1P12271 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
RLBP1P12271 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
RLBP1P12271 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
RLBP1P12271 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
RLBP1P12271 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
RLBP1P12271 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
RLBP1P12271 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
RLBP1P12271 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
RLBP1P12271 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
RLBP1P12271 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
RLBP1P12271 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
RLBP1P12271 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
RLBP1P12271 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
RLBP1P12271 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
RLBP1P12271 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.88
RLBP1P12271 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
RLBP1P12271 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
RLBP1P12271 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
RLBP1P12271 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
RLBP1P12271 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
RLBP1P12271 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
RLBP1P12271 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
RLBP1P12271 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
RLBP1P12271 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
RLBP1P12271 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
RLBP1P12271 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
RLBP1P12271 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
RLBP1P12271 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
RLBP1P12271 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
RLBP1P12271 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
RLBP1P12271 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
RLBP1P12271 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
RLBP1P12271 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
RLBP1P12271 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
RLBP1P12271 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
RLBP1P12271 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
RLBP1P12271 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
RLBP1P12271 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
RLBP1P12271 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
RLBP1P12271 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
RLBP1P12271 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
RLBP1P12271 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
RLBP1P12271 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
RLBP1P12271 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
RLBP1P12271 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
RLBP1P12271 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
RLBP1P12271 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
RLBP1P12271 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC32.87■■■□□ 2.85
RLBP1P12271 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
RLBP1P12271 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
RLBP1P12271 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
RLBP1P12271 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
RLBP1P12271 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
RLBP1P12271 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
RLBP1P12271 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
RLBP1P12271 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
RLBP1P12271 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
RLBP1P12271 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
RLBP1P12271 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
RLBP1P12271 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
RLBP1P12271 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
RLBP1P12271 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
RLBP1P12271 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
RLBP1P12271 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
RLBP1P12271 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
RLBP1P12271 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
RLBP1P12271 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
RLBP1P12271 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
RLBP1P12271 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
RLBP1P12271 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
RLBP1P12271 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
RLBP1P12271 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
RLBP1P12271 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
RLBP1P12271 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
RLBP1P12271 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
RLBP1P12271 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC32.79■■■□□ 2.84
RLBP1P12271 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
RLBP1P12271 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
RLBP1P12271 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
RLBP1P12271 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
RLBP1P12271 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
RLBP1P12271 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms