Protein–RNA interactions for Protein: P11171

EPB41, Protein 4.1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 864 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB41P11171 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
EPB41P11171 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
EPB41P11171 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
EPB41P11171 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
EPB41P11171 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
EPB41P11171 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
EPB41P11171 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
EPB41P11171 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
EPB41P11171 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
EPB41P11171 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
EPB41P11171 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
EPB41P11171 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
EPB41P11171 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
EPB41P11171 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
EPB41P11171 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
EPB41P11171 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
EPB41P11171 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
EPB41P11171 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
EPB41P11171 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
EPB41P11171 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
EPB41P11171 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
EPB41P11171 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
EPB41P11171 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
EPB41P11171 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
EPB41P11171 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
EPB41P11171 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
EPB41P11171 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
EPB41P11171 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
EPB41P11171 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
EPB41P11171 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
EPB41P11171 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
EPB41P11171 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
EPB41P11171 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
EPB41P11171 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
EPB41P11171 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
EPB41P11171 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
EPB41P11171 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
EPB41P11171 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
EPB41P11171 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
EPB41P11171 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
EPB41P11171 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
EPB41P11171 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
EPB41P11171 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
EPB41P11171 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
EPB41P11171 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
EPB41P11171 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
EPB41P11171 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
EPB41P11171 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
EPB41P11171 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
EPB41P11171 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
EPB41P11171 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
EPB41P11171 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
EPB41P11171 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
EPB41P11171 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
EPB41P11171 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
EPB41P11171 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
EPB41P11171 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
EPB41P11171 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
EPB41P11171 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
EPB41P11171 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
EPB41P11171 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
EPB41P11171 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
EPB41P11171 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
EPB41P11171 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
EPB41P11171 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
EPB41P11171 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
EPB41P11171 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
EPB41P11171 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
EPB41P11171 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
EPB41P11171 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
EPB41P11171 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
EPB41P11171 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
EPB41P11171 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
EPB41P11171 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
EPB41P11171 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
EPB41P11171 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
EPB41P11171 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
EPB41P11171 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
EPB41P11171 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
EPB41P11171 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
EPB41P11171 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
EPB41P11171 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
EPB41P11171 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
EPB41P11171 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
EPB41P11171 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
EPB41P11171 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
EPB41P11171 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
EPB41P11171 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
EPB41P11171 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
EPB41P11171 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
EPB41P11171 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
EPB41P11171 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
EPB41P11171 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
EPB41P11171 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
EPB41P11171 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
EPB41P11171 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
EPB41P11171 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
EPB41P11171 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
EPB41P11171 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
EPB41P11171 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms