Protein–RNA interactions for Protein: P10914

IRF1, Interferon regulatory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF1P10914 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
IRF1P10914 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
IRF1P10914 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
IRF1P10914 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
IRF1P10914 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
IRF1P10914 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
IRF1P10914 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
IRF1P10914 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
IRF1P10914 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
IRF1P10914 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
IRF1P10914 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
IRF1P10914 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
IRF1P10914 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
IRF1P10914 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
IRF1P10914 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
IRF1P10914 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
IRF1P10914 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
IRF1P10914 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
IRF1P10914 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
IRF1P10914 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
IRF1P10914 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
IRF1P10914 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
IRF1P10914 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
IRF1P10914 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
IRF1P10914 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
IRF1P10914 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
IRF1P10914 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
IRF1P10914 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
IRF1P10914 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
IRF1P10914 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
IRF1P10914 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
IRF1P10914 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
IRF1P10914 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
IRF1P10914 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
IRF1P10914 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
IRF1P10914 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
IRF1P10914 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
IRF1P10914 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
IRF1P10914 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
IRF1P10914 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
IRF1P10914 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
IRF1P10914 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
IRF1P10914 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
IRF1P10914 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
IRF1P10914 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
IRF1P10914 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
IRF1P10914 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
IRF1P10914 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
IRF1P10914 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
IRF1P10914 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
IRF1P10914 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
IRF1P10914 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
IRF1P10914 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
IRF1P10914 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
IRF1P10914 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
IRF1P10914 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
IRF1P10914 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
IRF1P10914 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
IRF1P10914 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
IRF1P10914 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
IRF1P10914 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
IRF1P10914 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
IRF1P10914 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
IRF1P10914 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
IRF1P10914 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
IRF1P10914 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
IRF1P10914 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
IRF1P10914 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
IRF1P10914 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
IRF1P10914 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
IRF1P10914 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
IRF1P10914 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
IRF1P10914 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
IRF1P10914 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
IRF1P10914 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
IRF1P10914 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
IRF1P10914 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
IRF1P10914 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
IRF1P10914 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
IRF1P10914 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
IRF1P10914 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
IRF1P10914 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
IRF1P10914 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
IRF1P10914 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
IRF1P10914 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
IRF1P10914 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
IRF1P10914 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
IRF1P10914 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
IRF1P10914 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
IRF1P10914 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
IRF1P10914 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
IRF1P10914 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
IRF1P10914 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
IRF1P10914 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
IRF1P10914 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
IRF1P10914 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
IRF1P10914 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
IRF1P10914 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
IRF1P10914 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
IRF1P10914 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms