Protein–RNA interactions for Protein: P10398

ARAF, Serine/threonine-protein kinase A-Raf, humanhuman

Predictions only

Length 606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARAFP10398 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARAFP10398 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARAFP10398 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARAFP10398 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARAFP10398 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARAFP10398 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARAFP10398 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ARAFP10398 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARAFP10398 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARAFP10398 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARAFP10398 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARAFP10398 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARAFP10398 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARAFP10398 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARAFP10398 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ARAFP10398 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARAFP10398 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARAFP10398 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARAFP10398 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARAFP10398 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARAFP10398 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARAFP10398 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARAFP10398 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARAFP10398 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARAFP10398 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARAFP10398 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARAFP10398 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARAFP10398 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARAFP10398 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARAFP10398 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARAFP10398 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARAFP10398 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARAFP10398 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARAFP10398 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARAFP10398 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ARAFP10398 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ARAFP10398 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARAFP10398 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARAFP10398 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARAFP10398 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARAFP10398 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARAFP10398 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARAFP10398 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARAFP10398 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARAFP10398 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARAFP10398 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARAFP10398 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARAFP10398 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARAFP10398 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARAFP10398 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARAFP10398 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARAFP10398 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARAFP10398 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARAFP10398 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARAFP10398 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARAFP10398 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
ARAFP10398 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARAFP10398 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARAFP10398 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARAFP10398 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARAFP10398 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARAFP10398 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARAFP10398 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARAFP10398 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARAFP10398 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARAFP10398 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ARAFP10398 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ARAFP10398 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ARAFP10398 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ARAFP10398 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ARAFP10398 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ARAFP10398 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ARAFP10398 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ARAFP10398 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARAFP10398 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARAFP10398 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARAFP10398 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARAFP10398 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ARAFP10398 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARAFP10398 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARAFP10398 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARAFP10398 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARAFP10398 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARAFP10398 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARAFP10398 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARAFP10398 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ARAFP10398 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARAFP10398 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARAFP10398 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ARAFP10398 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARAFP10398 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARAFP10398 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
ARAFP10398 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARAFP10398 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARAFP10398 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARAFP10398 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARAFP10398 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARAFP10398 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARAFP10398 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARAFP10398 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms