Protein–RNA interactions for Protein: P10070

GLI2, Zinc finger protein GLI2, humanhuman

Predictions only

Length 1,586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI2P10070 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
GLI2P10070 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC41.12■■■■■ 4.17
GLI2P10070 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
GLI2P10070 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
GLI2P10070 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
GLI2P10070 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
GLI2P10070 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
GLI2P10070 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC41.08■■■■■ 4.17
GLI2P10070 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.17
GLI2P10070 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.16
GLI2P10070 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.16
GLI2P10070 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
GLI2P10070 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC41.05■■■■■ 4.16
GLI2P10070 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC41.04■■■■■ 4.16
GLI2P10070 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
GLI2P10070 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
GLI2P10070 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC41.03■■■■■ 4.16
GLI2P10070 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC41.03■■■■■ 4.16
GLI2P10070 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.16
GLI2P10070 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC41■■■■■ 4.15
GLI2P10070 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC41■■■■■ 4.15
GLI2P10070 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
GLI2P10070 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC40.99■■■■■ 4.15
GLI2P10070 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC40.99■■■■■ 4.15
GLI2P10070 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC40.99■■■■■ 4.15
GLI2P10070 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
GLI2P10070 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC40.98■■■■■ 4.15
GLI2P10070 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
GLI2P10070 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC40.96■■■■■ 4.15
GLI2P10070 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC40.96■■■■■ 4.15
GLI2P10070 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC40.96■■■■■ 4.15
GLI2P10070 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
GLI2P10070 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
GLI2P10070 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC40.95■■■■■ 4.15
GLI2P10070 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
GLI2P10070 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
GLI2P10070 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
GLI2P10070 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC40.93■■■■■ 4.14
GLI2P10070 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.91■■■■■ 4.14
GLI2P10070 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC40.89■■■■■ 4.14
GLI2P10070 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC40.89■■■■■ 4.14
GLI2P10070 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC40.89■■■■■ 4.14
GLI2P10070 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC40.88■■■■■ 4.13
GLI2P10070 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.88■■■■■ 4.13
GLI2P10070 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC40.86■■■■■ 4.13
GLI2P10070 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC40.86■■■■■ 4.13
GLI2P10070 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC40.86■■■■■ 4.13
GLI2P10070 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
GLI2P10070 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC40.85■■■■■ 4.13
GLI2P10070 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC40.84■■■■■ 4.13
GLI2P10070 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC40.84■■■■■ 4.13
GLI2P10070 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC40.83■■■■■ 4.13
GLI2P10070 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
GLI2P10070 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC40.82■■■■■ 4.12
GLI2P10070 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC40.81■■■■■ 4.12
GLI2P10070 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC40.81■■■■■ 4.12
GLI2P10070 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC40.78■■■■■ 4.12
GLI2P10070 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
GLI2P10070 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
GLI2P10070 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC40.78■■■■■ 4.12
GLI2P10070 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
GLI2P10070 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
GLI2P10070 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC40.74■■■■■ 4.11
GLI2P10070 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.73■■■■■ 4.11
GLI2P10070 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC40.72■■■■■ 4.11
GLI2P10070 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC40.72■■■■■ 4.11
GLI2P10070 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
GLI2P10070 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
GLI2P10070 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.71■■■■■ 4.11
GLI2P10070 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
GLI2P10070 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.11
GLI2P10070 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.68■■■■■ 4.1
GLI2P10070 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
GLI2P10070 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC40.68■■■■■ 4.1
GLI2P10070 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.67■■■■■ 4.1
GLI2P10070 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
GLI2P10070 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC40.65■■■■■ 4.1
GLI2P10070 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.65■■■■■ 4.1
GLI2P10070 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC40.65■■■■■ 4.1
GLI2P10070 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
GLI2P10070 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC40.64■■■■■ 4.1
GLI2P10070 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC40.64■■■■■ 4.1
GLI2P10070 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC40.63■■■■■ 4.09
GLI2P10070 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
GLI2P10070 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
GLI2P10070 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC40.61■■■■■ 4.09
GLI2P10070 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC40.61■■■■■ 4.09
GLI2P10070 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
GLI2P10070 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC40.61■■■■■ 4.09
GLI2P10070 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC40.61■■■■■ 4.09
GLI2P10070 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC40.61■■■■■ 4.09
GLI2P10070 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC40.6■■■■■ 4.09
GLI2P10070 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC40.6■■■■■ 4.09
GLI2P10070 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.6■■■■■ 4.09
GLI2P10070 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC40.6■■■■■ 4.09
GLI2P10070 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
GLI2P10070 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
GLI2P10070 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
GLI2P10070 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC40.58■■■■■ 4.09
GLI2P10070 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms