Protein–RNA interactions for Protein: P08865

RPSA, 40S ribosomal protein SA, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPSAP08865 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPSAP08865 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RPSAP08865 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RPSAP08865 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RPSAP08865 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RPSAP08865 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RPSAP08865 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPSAP08865 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPSAP08865 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPSAP08865 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RPSAP08865 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RPSAP08865 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RPSAP08865 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPSAP08865 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPSAP08865 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPSAP08865 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
RPSAP08865 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RPSAP08865 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RPSAP08865 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RPSAP08865 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RPSAP08865 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RPSAP08865 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RPSAP08865 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPSAP08865 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPSAP08865 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPSAP08865 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPSAP08865 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPSAP08865 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPSAP08865 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPSAP08865 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPSAP08865 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPSAP08865 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPSAP08865 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPSAP08865 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPSAP08865 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
RPSAP08865 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RPSAP08865 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPSAP08865 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPSAP08865 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPSAP08865 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPSAP08865 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPSAP08865 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPSAP08865 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPSAP08865 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPSAP08865 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
RPSAP08865 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RPSAP08865 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RPSAP08865 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPSAP08865 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPSAP08865 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPSAP08865 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPSAP08865 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RPSAP08865 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RPSAP08865 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RPSAP08865 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPSAP08865 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPSAP08865 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPSAP08865 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPSAP08865 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPSAP08865 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPSAP08865 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPSAP08865 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPSAP08865 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPSAP08865 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPSAP08865 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPSAP08865 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPSAP08865 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPSAP08865 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPSAP08865 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPSAP08865 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPSAP08865 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RPSAP08865 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RPSAP08865 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RPSAP08865 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RPSAP08865 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPSAP08865 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPSAP08865 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPSAP08865 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPSAP08865 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
RPSAP08865 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPSAP08865 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPSAP08865 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPSAP08865 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPSAP08865 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPSAP08865 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RPSAP08865 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RPSAP08865 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RPSAP08865 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RPSAP08865 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RPSAP08865 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPSAP08865 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPSAP08865 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPSAP08865 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPSAP08865 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPSAP08865 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPSAP08865 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RPSAP08865 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RPSAP08865 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RPSAP08865 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RPSAP08865 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms