Protein–RNA interactions for Protein: P05230

FGF1, Fibroblast growth factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGF1P05230 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FGF1P05230 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FGF1P05230 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FGF1P05230 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FGF1P05230 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FGF1P05230 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
FGF1P05230 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
FGF1P05230 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
FGF1P05230 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
FGF1P05230 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
FGF1P05230 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
FGF1P05230 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
FGF1P05230 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
FGF1P05230 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
FGF1P05230 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
FGF1P05230 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
FGF1P05230 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
FGF1P05230 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
FGF1P05230 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
FGF1P05230 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
FGF1P05230 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
FGF1P05230 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FGF1P05230 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
FGF1P05230 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FGF1P05230 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FGF1P05230 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
FGF1P05230 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FGF1P05230 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FGF1P05230 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FGF1P05230 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FGF1P05230 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FGF1P05230 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FGF1P05230 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
FGF1P05230 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FGF1P05230 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
FGF1P05230 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FGF1P05230 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FGF1P05230 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FGF1P05230 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FGF1P05230 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FGF1P05230 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FGF1P05230 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FGF1P05230 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FGF1P05230 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FGF1P05230 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
FGF1P05230 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
FGF1P05230 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FGF1P05230 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
FGF1P05230 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
FGF1P05230 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
FGF1P05230 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FGF1P05230 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
FGF1P05230 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
FGF1P05230 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FGF1P05230 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FGF1P05230 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FGF1P05230 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FGF1P05230 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FGF1P05230 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
FGF1P05230 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
FGF1P05230 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FGF1P05230 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
FGF1P05230 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FGF1P05230 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FGF1P05230 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FGF1P05230 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FGF1P05230 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FGF1P05230 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FGF1P05230 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FGF1P05230 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FGF1P05230 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FGF1P05230 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FGF1P05230 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
FGF1P05230 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FGF1P05230 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
FGF1P05230 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26■■□□□ 1.75
FGF1P05230 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FGF1P05230 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FGF1P05230 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FGF1P05230 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
FGF1P05230 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FGF1P05230 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FGF1P05230 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
FGF1P05230 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FGF1P05230 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FGF1P05230 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
FGF1P05230 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FGF1P05230 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
FGF1P05230 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
FGF1P05230 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
FGF1P05230 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.75
FGF1P05230 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
FGF1P05230 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
FGF1P05230 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
FGF1P05230 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
FGF1P05230 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
FGF1P05230 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
FGF1P05230 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
FGF1P05230 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
FGF1P05230 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms