Protein–RNA interactions for Protein: P05114

HMGN1, Non-histone chromosomal protein HMG-14, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN1P05114 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HMGN1P05114 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HMGN1P05114 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HMGN1P05114 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HMGN1P05114 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HMGN1P05114 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HMGN1P05114 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HMGN1P05114 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HMGN1P05114 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HMGN1P05114 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HMGN1P05114 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
HMGN1P05114 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HMGN1P05114 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HMGN1P05114 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HMGN1P05114 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HMGN1P05114 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HMGN1P05114 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HMGN1P05114 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HMGN1P05114 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HMGN1P05114 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HMGN1P05114 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HMGN1P05114 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HMGN1P05114 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HMGN1P05114 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HMGN1P05114 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HMGN1P05114 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HMGN1P05114 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HMGN1P05114 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HMGN1P05114 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HMGN1P05114 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HMGN1P05114 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HMGN1P05114 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HMGN1P05114 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HMGN1P05114 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HMGN1P05114 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HMGN1P05114 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HMGN1P05114 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HMGN1P05114 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HMGN1P05114 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HMGN1P05114 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HMGN1P05114 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HMGN1P05114 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HMGN1P05114 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HMGN1P05114 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HMGN1P05114 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HMGN1P05114 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HMGN1P05114 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HMGN1P05114 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
HMGN1P05114 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HMGN1P05114 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HMGN1P05114 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HMGN1P05114 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
HMGN1P05114 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HMGN1P05114 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HMGN1P05114 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HMGN1P05114 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HMGN1P05114 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HMGN1P05114 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HMGN1P05114 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HMGN1P05114 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HMGN1P05114 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HMGN1P05114 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HMGN1P05114 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HMGN1P05114 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HMGN1P05114 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
HMGN1P05114 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HMGN1P05114 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HMGN1P05114 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HMGN1P05114 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HMGN1P05114 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HMGN1P05114 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HMGN1P05114 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HMGN1P05114 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HMGN1P05114 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HMGN1P05114 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HMGN1P05114 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HMGN1P05114 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HMGN1P05114 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HMGN1P05114 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HMGN1P05114 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HMGN1P05114 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HMGN1P05114 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HMGN1P05114 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HMGN1P05114 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HMGN1P05114 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HMGN1P05114 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HMGN1P05114 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HMGN1P05114 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HMGN1P05114 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HMGN1P05114 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HMGN1P05114 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HMGN1P05114 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
HMGN1P05114 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HMGN1P05114 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HMGN1P05114 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HMGN1P05114 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HMGN1P05114 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HMGN1P05114 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HMGN1P05114 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HMGN1P05114 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 190.5 ms