Protein–RNA interactions for Protein: P04004

VTN, Vitronectin, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTNP04004 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
VTNP04004 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
VTNP04004 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
VTNP04004 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
VTNP04004 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
VTNP04004 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
VTNP04004 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
VTNP04004 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
VTNP04004 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
VTNP04004 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
VTNP04004 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
VTNP04004 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
VTNP04004 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
VTNP04004 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
VTNP04004 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
VTNP04004 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
VTNP04004 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
VTNP04004 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
VTNP04004 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
VTNP04004 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
VTNP04004 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
VTNP04004 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
VTNP04004 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
VTNP04004 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
VTNP04004 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
VTNP04004 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
VTNP04004 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.19
VTNP04004 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
VTNP04004 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
VTNP04004 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
VTNP04004 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
VTNP04004 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
VTNP04004 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
VTNP04004 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
VTNP04004 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
VTNP04004 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
VTNP04004 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
VTNP04004 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
VTNP04004 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
VTNP04004 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
VTNP04004 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
VTNP04004 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
VTNP04004 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
VTNP04004 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
VTNP04004 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
VTNP04004 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
VTNP04004 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
VTNP04004 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
VTNP04004 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
VTNP04004 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
VTNP04004 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
VTNP04004 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
VTNP04004 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
VTNP04004 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
VTNP04004 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
VTNP04004 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
VTNP04004 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
VTNP04004 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
VTNP04004 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
VTNP04004 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
VTNP04004 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
VTNP04004 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
VTNP04004 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
VTNP04004 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
VTNP04004 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
VTNP04004 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
VTNP04004 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
VTNP04004 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
VTNP04004 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
VTNP04004 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
VTNP04004 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
VTNP04004 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
VTNP04004 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
VTNP04004 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
VTNP04004 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
VTNP04004 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
VTNP04004 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
VTNP04004 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
VTNP04004 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
VTNP04004 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
VTNP04004 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
VTNP04004 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
VTNP04004 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
VTNP04004 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
VTNP04004 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
VTNP04004 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
VTNP04004 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
VTNP04004 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
VTNP04004 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
VTNP04004 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
VTNP04004 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
VTNP04004 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
VTNP04004 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
VTNP04004 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
VTNP04004 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
VTNP04004 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
VTNP04004 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
VTNP04004 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
VTNP04004 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
VTNP04004 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms