Protein–RNA interactions for Protein: O95342

ABCB11, Bile salt export pump, humanhuman

Predictions only

Length 1,321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB11O95342 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
ABCB11O95342 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
ABCB11O95342 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
ABCB11O95342 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
ABCB11O95342 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ABCB11O95342 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ABCB11O95342 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
ABCB11O95342 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
ABCB11O95342 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC29.96■■■□□ 2.39
ABCB11O95342 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
ABCB11O95342 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
ABCB11O95342 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
ABCB11O95342 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
ABCB11O95342 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
ABCB11O95342 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
ABCB11O95342 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
ABCB11O95342 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
ABCB11O95342 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
ABCB11O95342 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
ABCB11O95342 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.92■■■□□ 2.38
ABCB11O95342 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
ABCB11O95342 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ABCB11O95342 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ABCB11O95342 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
ABCB11O95342 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ABCB11O95342 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ABCB11O95342 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ABCB11O95342 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ABCB11O95342 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
ABCB11O95342 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ABCB11O95342 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ABCB11O95342 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
ABCB11O95342 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
ABCB11O95342 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
ABCB11O95342 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
ABCB11O95342 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
ABCB11O95342 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
ABCB11O95342 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
ABCB11O95342 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
ABCB11O95342 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
ABCB11O95342 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
ABCB11O95342 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
ABCB11O95342 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
ABCB11O95342 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
ABCB11O95342 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.37
ABCB11O95342 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.37
ABCB11O95342 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
ABCB11O95342 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ABCB11O95342 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ABCB11O95342 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
ABCB11O95342 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
ABCB11O95342 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
ABCB11O95342 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
ABCB11O95342 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
ABCB11O95342 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
ABCB11O95342 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
ABCB11O95342 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
ABCB11O95342 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ABCB11O95342 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
ABCB11O95342 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
ABCB11O95342 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
ABCB11O95342 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
ABCB11O95342 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ABCB11O95342 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
ABCB11O95342 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ABCB11O95342 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
ABCB11O95342 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
ABCB11O95342 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
ABCB11O95342 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
ABCB11O95342 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
ABCB11O95342 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
ABCB11O95342 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
ABCB11O95342 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
ABCB11O95342 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
ABCB11O95342 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
ABCB11O95342 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
ABCB11O95342 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
ABCB11O95342 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
ABCB11O95342 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
ABCB11O95342 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
ABCB11O95342 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ABCB11O95342 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
ABCB11O95342 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
ABCB11O95342 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
ABCB11O95342 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
ABCB11O95342 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
ABCB11O95342 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
ABCB11O95342 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
ABCB11O95342 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
ABCB11O95342 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
ABCB11O95342 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ABCB11O95342 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ABCB11O95342 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
ABCB11O95342 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ABCB11O95342 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
ABCB11O95342 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ABCB11O95342 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
ABCB11O95342 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ABCB11O95342 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
ABCB11O95342 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms