Protein–RNA interactions for Protein: O95045

UPP2, Uridine phosphorylase 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP2O95045 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
UPP2O95045 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
UPP2O95045 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
UPP2O95045 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
UPP2O95045 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
UPP2O95045 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
UPP2O95045 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
UPP2O95045 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
UPP2O95045 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
UPP2O95045 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
UPP2O95045 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
UPP2O95045 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
UPP2O95045 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
UPP2O95045 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
UPP2O95045 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
UPP2O95045 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
UPP2O95045 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
UPP2O95045 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
UPP2O95045 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
UPP2O95045 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
UPP2O95045 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
UPP2O95045 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
UPP2O95045 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
UPP2O95045 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
UPP2O95045 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
UPP2O95045 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
UPP2O95045 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
UPP2O95045 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
UPP2O95045 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
UPP2O95045 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
UPP2O95045 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
UPP2O95045 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
UPP2O95045 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
UPP2O95045 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
UPP2O95045 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
UPP2O95045 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
UPP2O95045 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
UPP2O95045 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
UPP2O95045 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
UPP2O95045 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
UPP2O95045 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
UPP2O95045 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
UPP2O95045 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
UPP2O95045 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
UPP2O95045 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
UPP2O95045 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
UPP2O95045 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
UPP2O95045 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
UPP2O95045 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
UPP2O95045 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
UPP2O95045 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
UPP2O95045 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
UPP2O95045 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
UPP2O95045 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
UPP2O95045 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
UPP2O95045 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
UPP2O95045 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
UPP2O95045 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
UPP2O95045 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
UPP2O95045 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
UPP2O95045 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
UPP2O95045 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
UPP2O95045 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
UPP2O95045 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
UPP2O95045 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
UPP2O95045 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
UPP2O95045 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
UPP2O95045 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
UPP2O95045 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
UPP2O95045 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
UPP2O95045 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
UPP2O95045 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
UPP2O95045 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
UPP2O95045 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
UPP2O95045 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
UPP2O95045 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
UPP2O95045 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
UPP2O95045 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
UPP2O95045 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
UPP2O95045 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
UPP2O95045 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
UPP2O95045 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
UPP2O95045 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
UPP2O95045 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
UPP2O95045 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
UPP2O95045 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
UPP2O95045 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
UPP2O95045 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
UPP2O95045 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
UPP2O95045 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
UPP2O95045 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
UPP2O95045 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
UPP2O95045 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
UPP2O95045 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
UPP2O95045 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
UPP2O95045 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
UPP2O95045 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
UPP2O95045 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
UPP2O95045 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
UPP2O95045 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms