Protein–RNA interactions for Protein: O94972

TRIM37, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM37, humanhuman

Predictions only

Length 964 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM37O94972 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC34.51■■■■□ 3.12
TRIM37O94972 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
TRIM37O94972 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.12
TRIM37O94972 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
TRIM37O94972 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.12
TRIM37O94972 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
TRIM37O94972 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
TRIM37O94972 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
TRIM37O94972 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
TRIM37O94972 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
TRIM37O94972 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
TRIM37O94972 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
TRIM37O94972 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
TRIM37O94972 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
TRIM37O94972 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
TRIM37O94972 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
TRIM37O94972 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
TRIM37O94972 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
TRIM37O94972 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
TRIM37O94972 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
TRIM37O94972 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC34.41■■■■□ 3.1
TRIM37O94972 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
TRIM37O94972 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
TRIM37O94972 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
TRIM37O94972 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
TRIM37O94972 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
TRIM37O94972 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
TRIM37O94972 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
TRIM37O94972 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
TRIM37O94972 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
TRIM37O94972 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
TRIM37O94972 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.37■■■■□ 3.09
TRIM37O94972 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
TRIM37O94972 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
TRIM37O94972 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
TRIM37O94972 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
TRIM37O94972 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
TRIM37O94972 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC34.31■■■■□ 3.08
TRIM37O94972 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
TRIM37O94972 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
TRIM37O94972 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
TRIM37O94972 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
TRIM37O94972 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
TRIM37O94972 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC34.29■■■■□ 3.08
TRIM37O94972 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
TRIM37O94972 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
TRIM37O94972 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
TRIM37O94972 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
TRIM37O94972 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
TRIM37O94972 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
TRIM37O94972 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
TRIM37O94972 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
TRIM37O94972 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.08
TRIM37O94972 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.08
TRIM37O94972 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
TRIM37O94972 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
TRIM37O94972 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
TRIM37O94972 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
TRIM37O94972 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
TRIM37O94972 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
TRIM37O94972 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
TRIM37O94972 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
TRIM37O94972 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
TRIM37O94972 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
TRIM37O94972 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC34.19■■■■□ 3.06
TRIM37O94972 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC34.18■■■■□ 3.06
TRIM37O94972 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
TRIM37O94972 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
TRIM37O94972 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
TRIM37O94972 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
TRIM37O94972 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
TRIM37O94972 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
TRIM37O94972 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
TRIM37O94972 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
TRIM37O94972 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
TRIM37O94972 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC34.14■■■■□ 3.06
TRIM37O94972 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
TRIM37O94972 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
TRIM37O94972 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
TRIM37O94972 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
TRIM37O94972 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
TRIM37O94972 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
TRIM37O94972 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
TRIM37O94972 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
TRIM37O94972 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
TRIM37O94972 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
TRIM37O94972 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
TRIM37O94972 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
TRIM37O94972 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC34.08■■■■□ 3.05
TRIM37O94972 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
TRIM37O94972 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
TRIM37O94972 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
TRIM37O94972 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
TRIM37O94972 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
TRIM37O94972 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
TRIM37O94972 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
TRIM37O94972 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
TRIM37O94972 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC34.03■■■■□ 3.04
TRIM37O94972 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
TRIM37O94972 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms