Protein–RNA interactions for Protein: O75648

TRMU, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMUO75648 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRMUO75648 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRMUO75648 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRMUO75648 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRMUO75648 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRMUO75648 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRMUO75648 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRMUO75648 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRMUO75648 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRMUO75648 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRMUO75648 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRMUO75648 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRMUO75648 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TRMUO75648 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRMUO75648 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRMUO75648 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRMUO75648 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRMUO75648 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRMUO75648 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRMUO75648 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRMUO75648 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRMUO75648 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRMUO75648 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRMUO75648 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRMUO75648 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRMUO75648 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TRMUO75648 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRMUO75648 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
TRMUO75648 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRMUO75648 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRMUO75648 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRMUO75648 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRMUO75648 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRMUO75648 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRMUO75648 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRMUO75648 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRMUO75648 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRMUO75648 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRMUO75648 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRMUO75648 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TRMUO75648 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRMUO75648 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRMUO75648 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRMUO75648 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRMUO75648 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRMUO75648 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRMUO75648 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TRMUO75648 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRMUO75648 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRMUO75648 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRMUO75648 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRMUO75648 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
TRMUO75648 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRMUO75648 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRMUO75648 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
TRMUO75648 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRMUO75648 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRMUO75648 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRMUO75648 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRMUO75648 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRMUO75648 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TRMUO75648 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRMUO75648 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRMUO75648 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRMUO75648 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRMUO75648 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRMUO75648 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRMUO75648 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRMUO75648 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRMUO75648 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRMUO75648 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRMUO75648 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRMUO75648 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRMUO75648 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRMUO75648 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRMUO75648 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRMUO75648 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRMUO75648 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRMUO75648 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRMUO75648 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRMUO75648 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRMUO75648 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRMUO75648 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRMUO75648 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRMUO75648 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRMUO75648 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRMUO75648 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRMUO75648 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRMUO75648 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRMUO75648 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRMUO75648 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRMUO75648 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRMUO75648 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRMUO75648 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
TRMUO75648 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRMUO75648 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRMUO75648 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRMUO75648 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRMUO75648 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRMUO75648 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms