Protein–RNA interactions for Protein: O75592

MYCBP2, E3 ubiquitin-protein ligase MYCBP2, humanhuman

Predictions only

Length 4,640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCBP2O75592 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MYCBP2O75592 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MYCBP2O75592 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MYCBP2O75592 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
MYCBP2O75592 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MYCBP2O75592 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MYCBP2O75592 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MYCBP2O75592 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MYCBP2O75592 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MYCBP2O75592 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MYCBP2O75592 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MYCBP2O75592 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MYCBP2O75592 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MYCBP2O75592 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MYCBP2O75592 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MYCBP2O75592 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MYCBP2O75592 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MYCBP2O75592 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MYCBP2O75592 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MYCBP2O75592 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
MYCBP2O75592 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MYCBP2O75592 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
MYCBP2O75592 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
MYCBP2O75592 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MYCBP2O75592 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MYCBP2O75592 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MYCBP2O75592 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MYCBP2O75592 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MYCBP2O75592 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MYCBP2O75592 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MYCBP2O75592 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MYCBP2O75592 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MYCBP2O75592 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MYCBP2O75592 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MYCBP2O75592 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MYCBP2O75592 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MYCBP2O75592 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MYCBP2O75592 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MYCBP2O75592 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MYCBP2O75592 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
MYCBP2O75592 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MYCBP2O75592 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MYCBP2O75592 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MYCBP2O75592 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MYCBP2O75592 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MYCBP2O75592 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MYCBP2O75592 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MYCBP2O75592 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MYCBP2O75592 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MYCBP2O75592 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MYCBP2O75592 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MYCBP2O75592 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MYCBP2O75592 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MYCBP2O75592 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
MYCBP2O75592 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
MYCBP2O75592 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MYCBP2O75592 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MYCBP2O75592 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MYCBP2O75592 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MYCBP2O75592 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MYCBP2O75592 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MYCBP2O75592 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MYCBP2O75592 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MYCBP2O75592 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MYCBP2O75592 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MYCBP2O75592 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MYCBP2O75592 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MYCBP2O75592 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MYCBP2O75592 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MYCBP2O75592 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MYCBP2O75592 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MYCBP2O75592 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MYCBP2O75592 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MYCBP2O75592 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MYCBP2O75592 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MYCBP2O75592 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MYCBP2O75592 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MYCBP2O75592 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MYCBP2O75592 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MYCBP2O75592 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MYCBP2O75592 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MYCBP2O75592 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MYCBP2O75592 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MYCBP2O75592 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MYCBP2O75592 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MYCBP2O75592 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MYCBP2O75592 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MYCBP2O75592 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MYCBP2O75592 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MYCBP2O75592 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MYCBP2O75592 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MYCBP2O75592 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MYCBP2O75592 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MYCBP2O75592 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MYCBP2O75592 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MYCBP2O75592 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MYCBP2O75592 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MYCBP2O75592 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MYCBP2O75592 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MYCBP2O75592 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.2 ms