Protein–RNA interactions for Protein: O75410

TACC1, Transforming acidic coiled-coil-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 805 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TACC1O75410 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TACC1O75410 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TACC1O75410 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TACC1O75410 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TACC1O75410 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TACC1O75410 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TACC1O75410 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TACC1O75410 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TACC1O75410 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TACC1O75410 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TACC1O75410 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TACC1O75410 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TACC1O75410 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TACC1O75410 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TACC1O75410 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TACC1O75410 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TACC1O75410 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TACC1O75410 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TACC1O75410 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TACC1O75410 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TACC1O75410 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TACC1O75410 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TACC1O75410 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TACC1O75410 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TACC1O75410 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TACC1O75410 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TACC1O75410 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TACC1O75410 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TACC1O75410 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TACC1O75410 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
TACC1O75410 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TACC1O75410 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
TACC1O75410 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
TACC1O75410 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
TACC1O75410 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TACC1O75410 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TACC1O75410 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TACC1O75410 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TACC1O75410 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TACC1O75410 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TACC1O75410 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TACC1O75410 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TACC1O75410 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TACC1O75410 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TACC1O75410 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TACC1O75410 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TACC1O75410 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
TACC1O75410 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
TACC1O75410 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TACC1O75410 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TACC1O75410 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TACC1O75410 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TACC1O75410 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TACC1O75410 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TACC1O75410 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TACC1O75410 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TACC1O75410 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TACC1O75410 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TACC1O75410 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TACC1O75410 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TACC1O75410 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TACC1O75410 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TACC1O75410 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TACC1O75410 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TACC1O75410 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TACC1O75410 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TACC1O75410 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TACC1O75410 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TACC1O75410 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TACC1O75410 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TACC1O75410 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TACC1O75410 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TACC1O75410 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TACC1O75410 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TACC1O75410 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TACC1O75410 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TACC1O75410 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TACC1O75410 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TACC1O75410 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TACC1O75410 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TACC1O75410 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TACC1O75410 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TACC1O75410 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TACC1O75410 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TACC1O75410 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TACC1O75410 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TACC1O75410 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TACC1O75410 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TACC1O75410 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TACC1O75410 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TACC1O75410 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TACC1O75410 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TACC1O75410 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TACC1O75410 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TACC1O75410 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TACC1O75410 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TACC1O75410 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TACC1O75410 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
TACC1O75410 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
TACC1O75410 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.7 ms