Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
PPFIA3O75145 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
PPFIA3O75145 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
PPFIA3O75145 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
PPFIA3O75145 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PPFIA3O75145 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PPFIA3O75145 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
PPFIA3O75145 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
PPFIA3O75145 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
PPFIA3O75145 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
PPFIA3O75145 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PPFIA3O75145 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
PPFIA3O75145 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
PPFIA3O75145 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PPFIA3O75145 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
PPFIA3O75145 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
PPFIA3O75145 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
PPFIA3O75145 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
PPFIA3O75145 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
PPFIA3O75145 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC30.33■■■□□ 2.45
PPFIA3O75145 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
PPFIA3O75145 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
PPFIA3O75145 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
PPFIA3O75145 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
PPFIA3O75145 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
PPFIA3O75145 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PPFIA3O75145 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
PPFIA3O75145 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PPFIA3O75145 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC30.29■■■□□ 2.44
PPFIA3O75145 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
PPFIA3O75145 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
PPFIA3O75145 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
PPFIA3O75145 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
PPFIA3O75145 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PPFIA3O75145 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PPFIA3O75145 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
PPFIA3O75145 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PPFIA3O75145 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PPFIA3O75145 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PPFIA3O75145 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PPFIA3O75145 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
PPFIA3O75145 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PPFIA3O75145 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
PPFIA3O75145 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PPFIA3O75145 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PPFIA3O75145 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PPFIA3O75145 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PPFIA3O75145 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC30.18■■■□□ 2.42
PPFIA3O75145 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PPFIA3O75145 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
PPFIA3O75145 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PPFIA3O75145 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
PPFIA3O75145 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
PPFIA3O75145 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
PPFIA3O75145 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PPFIA3O75145 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
PPFIA3O75145 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
PPFIA3O75145 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
PPFIA3O75145 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
PPFIA3O75145 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PPFIA3O75145 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PPFIA3O75145 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
PPFIA3O75145 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC30.11■■■□□ 2.41
PPFIA3O75145 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
PPFIA3O75145 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
PPFIA3O75145 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PPFIA3O75145 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PPFIA3O75145 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PPFIA3O75145 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PPFIA3O75145 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PPFIA3O75145 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
PPFIA3O75145 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PPFIA3O75145 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PPFIA3O75145 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PPFIA3O75145 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PPFIA3O75145 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PPFIA3O75145 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
PPFIA3O75145 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PPFIA3O75145 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PPFIA3O75145 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
PPFIA3O75145 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PPFIA3O75145 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PPFIA3O75145 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PPFIA3O75145 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PPFIA3O75145 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PPFIA3O75145 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PPFIA3O75145 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PPFIA3O75145 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
PPFIA3O75145 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
PPFIA3O75145 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
PPFIA3O75145 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PPFIA3O75145 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
PPFIA3O75145 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
PPFIA3O75145 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PPFIA3O75145 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PPFIA3O75145 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PPFIA3O75145 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PPFIA3O75145 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PPFIA3O75145 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PPFIA3O75145 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms