Protein–RNA interactions for Protein: O60885

BRD4, Bromodomain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD4O60885 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
BRD4O60885 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
BRD4O60885 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
BRD4O60885 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
BRD4O60885 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
BRD4O60885 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
BRD4O60885 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
BRD4O60885 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
BRD4O60885 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
BRD4O60885 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
BRD4O60885 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
BRD4O60885 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
BRD4O60885 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
BRD4O60885 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
BRD4O60885 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
BRD4O60885 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
BRD4O60885 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
BRD4O60885 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
BRD4O60885 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
BRD4O60885 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
BRD4O60885 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC36.2■■■■□ 3.39
BRD4O60885 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
BRD4O60885 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
BRD4O60885 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
BRD4O60885 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC36.19■■■■□ 3.38
BRD4O60885 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
BRD4O60885 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
BRD4O60885 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
BRD4O60885 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
BRD4O60885 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
BRD4O60885 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC36.16■■■■□ 3.38
BRD4O60885 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC36.15■■■■□ 3.38
BRD4O60885 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
BRD4O60885 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
BRD4O60885 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC36.14■■■■□ 3.38
BRD4O60885 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
BRD4O60885 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
BRD4O60885 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
BRD4O60885 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
BRD4O60885 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
BRD4O60885 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
BRD4O60885 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
BRD4O60885 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
BRD4O60885 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
BRD4O60885 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
BRD4O60885 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
BRD4O60885 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC36.08■■■■□ 3.37
BRD4O60885 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC36.07■■■■□ 3.36
BRD4O60885 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.36
BRD4O60885 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.36
BRD4O60885 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
BRD4O60885 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
BRD4O60885 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
BRD4O60885 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
BRD4O60885 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
BRD4O60885 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
BRD4O60885 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
BRD4O60885 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC36.03■■■■□ 3.36
BRD4O60885 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
BRD4O60885 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
BRD4O60885 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
BRD4O60885 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
BRD4O60885 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
BRD4O60885 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
BRD4O60885 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
BRD4O60885 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC35.99■■■■□ 3.35
BRD4O60885 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
BRD4O60885 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
BRD4O60885 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
BRD4O60885 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
BRD4O60885 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
BRD4O60885 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
BRD4O60885 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
BRD4O60885 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
BRD4O60885 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC35.96■■■■□ 3.35
BRD4O60885 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
BRD4O60885 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
BRD4O60885 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
BRD4O60885 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.35
BRD4O60885 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.35
BRD4O60885 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
BRD4O60885 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
BRD4O60885 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
BRD4O60885 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
BRD4O60885 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
BRD4O60885 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
BRD4O60885 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
BRD4O60885 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC35.93■■■■□ 3.34
BRD4O60885 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
BRD4O60885 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
BRD4O60885 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
BRD4O60885 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
BRD4O60885 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.91■■■■□ 3.34
BRD4O60885 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
BRD4O60885 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
BRD4O60885 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
BRD4O60885 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
BRD4O60885 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
BRD4O60885 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
BRD4O60885 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms