Protein–RNA interactions for Protein: O60811

PRAMEF2, PRAME family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF2O60811 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRAMEF2O60811 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRAMEF2O60811 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRAMEF2O60811 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRAMEF2O60811 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRAMEF2O60811 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRAMEF2O60811 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRAMEF2O60811 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRAMEF2O60811 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRAMEF2O60811 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRAMEF2O60811 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRAMEF2O60811 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRAMEF2O60811 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PRAMEF2O60811 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRAMEF2O60811 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRAMEF2O60811 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRAMEF2O60811 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRAMEF2O60811 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRAMEF2O60811 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRAMEF2O60811 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRAMEF2O60811 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRAMEF2O60811 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRAMEF2O60811 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRAMEF2O60811 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRAMEF2O60811 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRAMEF2O60811 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRAMEF2O60811 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRAMEF2O60811 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRAMEF2O60811 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRAMEF2O60811 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRAMEF2O60811 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRAMEF2O60811 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRAMEF2O60811 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRAMEF2O60811 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRAMEF2O60811 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRAMEF2O60811 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRAMEF2O60811 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRAMEF2O60811 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRAMEF2O60811 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRAMEF2O60811 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRAMEF2O60811 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRAMEF2O60811 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRAMEF2O60811 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRAMEF2O60811 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRAMEF2O60811 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRAMEF2O60811 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRAMEF2O60811 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRAMEF2O60811 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRAMEF2O60811 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRAMEF2O60811 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRAMEF2O60811 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRAMEF2O60811 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRAMEF2O60811 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRAMEF2O60811 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PRAMEF2O60811 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRAMEF2O60811 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRAMEF2O60811 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRAMEF2O60811 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRAMEF2O60811 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRAMEF2O60811 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PRAMEF2O60811 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PRAMEF2O60811 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRAMEF2O60811 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PRAMEF2O60811 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRAMEF2O60811 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRAMEF2O60811 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PRAMEF2O60811 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRAMEF2O60811 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRAMEF2O60811 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRAMEF2O60811 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRAMEF2O60811 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRAMEF2O60811 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRAMEF2O60811 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRAMEF2O60811 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRAMEF2O60811 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PRAMEF2O60811 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PRAMEF2O60811 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PRAMEF2O60811 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRAMEF2O60811 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRAMEF2O60811 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PRAMEF2O60811 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRAMEF2O60811 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRAMEF2O60811 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PRAMEF2O60811 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PRAMEF2O60811 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRAMEF2O60811 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRAMEF2O60811 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRAMEF2O60811 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRAMEF2O60811 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PRAMEF2O60811 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRAMEF2O60811 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRAMEF2O60811 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRAMEF2O60811 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRAMEF2O60811 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRAMEF2O60811 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PRAMEF2O60811 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRAMEF2O60811 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRAMEF2O60811 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRAMEF2O60811 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PRAMEF2O60811 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms