Protein–RNA interactions for Protein: O60359

CACNG3, Voltage-dependent calcium channel gamma-3 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG3O60359 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
CACNG3O60359 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CACNG3O60359 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CACNG3O60359 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CACNG3O60359 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CACNG3O60359 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CACNG3O60359 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CACNG3O60359 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CACNG3O60359 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CACNG3O60359 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CACNG3O60359 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CACNG3O60359 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CACNG3O60359 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
CACNG3O60359 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
CACNG3O60359 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CACNG3O60359 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CACNG3O60359 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CACNG3O60359 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
CACNG3O60359 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CACNG3O60359 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CACNG3O60359 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CACNG3O60359 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CACNG3O60359 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CACNG3O60359 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CACNG3O60359 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CACNG3O60359 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CACNG3O60359 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CACNG3O60359 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CACNG3O60359 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CACNG3O60359 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CACNG3O60359 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CACNG3O60359 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CACNG3O60359 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CACNG3O60359 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CACNG3O60359 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CACNG3O60359 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CACNG3O60359 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CACNG3O60359 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CACNG3O60359 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CACNG3O60359 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CACNG3O60359 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CACNG3O60359 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CACNG3O60359 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CACNG3O60359 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CACNG3O60359 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CACNG3O60359 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CACNG3O60359 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CACNG3O60359 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CACNG3O60359 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CACNG3O60359 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CACNG3O60359 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CACNG3O60359 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CACNG3O60359 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CACNG3O60359 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CACNG3O60359 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CACNG3O60359 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CACNG3O60359 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CACNG3O60359 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CACNG3O60359 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CACNG3O60359 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CACNG3O60359 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CACNG3O60359 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CACNG3O60359 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CACNG3O60359 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CACNG3O60359 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CACNG3O60359 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CACNG3O60359 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CACNG3O60359 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CACNG3O60359 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CACNG3O60359 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CACNG3O60359 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CACNG3O60359 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CACNG3O60359 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CACNG3O60359 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CACNG3O60359 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CACNG3O60359 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CACNG3O60359 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CACNG3O60359 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CACNG3O60359 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CACNG3O60359 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CACNG3O60359 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CACNG3O60359 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CACNG3O60359 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CACNG3O60359 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CACNG3O60359 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CACNG3O60359 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CACNG3O60359 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CACNG3O60359 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CACNG3O60359 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CACNG3O60359 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CACNG3O60359 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CACNG3O60359 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CACNG3O60359 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CACNG3O60359 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
CACNG3O60359 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CACNG3O60359 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CACNG3O60359 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CACNG3O60359 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CACNG3O60359 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CACNG3O60359 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms