Protein–RNA interactions for Protein: O43639

NCK2, Cytoplasmic protein NCK2, humanhuman

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCK2O43639 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NCK2O43639 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NCK2O43639 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NCK2O43639 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NCK2O43639 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NCK2O43639 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NCK2O43639 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NCK2O43639 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NCK2O43639 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NCK2O43639 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NCK2O43639 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NCK2O43639 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NCK2O43639 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NCK2O43639 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NCK2O43639 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NCK2O43639 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NCK2O43639 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NCK2O43639 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NCK2O43639 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NCK2O43639 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NCK2O43639 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NCK2O43639 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NCK2O43639 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NCK2O43639 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NCK2O43639 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.51■■■□□ 2.16
NCK2O43639 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
NCK2O43639 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
NCK2O43639 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NCK2O43639 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NCK2O43639 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NCK2O43639 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NCK2O43639 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NCK2O43639 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NCK2O43639 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
NCK2O43639 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NCK2O43639 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NCK2O43639 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NCK2O43639 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NCK2O43639 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NCK2O43639 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NCK2O43639 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NCK2O43639 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NCK2O43639 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NCK2O43639 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NCK2O43639 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NCK2O43639 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NCK2O43639 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NCK2O43639 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NCK2O43639 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NCK2O43639 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NCK2O43639 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NCK2O43639 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NCK2O43639 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NCK2O43639 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NCK2O43639 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NCK2O43639 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NCK2O43639 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NCK2O43639 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NCK2O43639 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NCK2O43639 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NCK2O43639 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NCK2O43639 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NCK2O43639 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
NCK2O43639 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NCK2O43639 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NCK2O43639 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NCK2O43639 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NCK2O43639 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NCK2O43639 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NCK2O43639 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NCK2O43639 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NCK2O43639 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NCK2O43639 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NCK2O43639 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NCK2O43639 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NCK2O43639 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NCK2O43639 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
NCK2O43639 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
NCK2O43639 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
NCK2O43639 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
NCK2O43639 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
NCK2O43639 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
NCK2O43639 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
NCK2O43639 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
NCK2O43639 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
NCK2O43639 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NCK2O43639 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NCK2O43639 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NCK2O43639 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NCK2O43639 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NCK2O43639 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NCK2O43639 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NCK2O43639 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NCK2O43639 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NCK2O43639 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NCK2O43639 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NCK2O43639 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NCK2O43639 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NCK2O43639 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NCK2O43639 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms