Protein–RNA interactions for Protein: O43396

TXNL1, Thioredoxin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNL1O43396 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TXNL1O43396 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TXNL1O43396 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TXNL1O43396 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TXNL1O43396 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TXNL1O43396 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TXNL1O43396 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TXNL1O43396 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TXNL1O43396 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TXNL1O43396 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TXNL1O43396 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TXNL1O43396 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TXNL1O43396 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TXNL1O43396 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TXNL1O43396 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
TXNL1O43396 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TXNL1O43396 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TXNL1O43396 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TXNL1O43396 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TXNL1O43396 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TXNL1O43396 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TXNL1O43396 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TXNL1O43396 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TXNL1O43396 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TXNL1O43396 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TXNL1O43396 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TXNL1O43396 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TXNL1O43396 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TXNL1O43396 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TXNL1O43396 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TXNL1O43396 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TXNL1O43396 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TXNL1O43396 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TXNL1O43396 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TXNL1O43396 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TXNL1O43396 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TXNL1O43396 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TXNL1O43396 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TXNL1O43396 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TXNL1O43396 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TXNL1O43396 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TXNL1O43396 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TXNL1O43396 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TXNL1O43396 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TXNL1O43396 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TXNL1O43396 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TXNL1O43396 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TXNL1O43396 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TXNL1O43396 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TXNL1O43396 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TXNL1O43396 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TXNL1O43396 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TXNL1O43396 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TXNL1O43396 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TXNL1O43396 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TXNL1O43396 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TXNL1O43396 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TXNL1O43396 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TXNL1O43396 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TXNL1O43396 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TXNL1O43396 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TXNL1O43396 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TXNL1O43396 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TXNL1O43396 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TXNL1O43396 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TXNL1O43396 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TXNL1O43396 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TXNL1O43396 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TXNL1O43396 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
TXNL1O43396 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TXNL1O43396 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TXNL1O43396 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TXNL1O43396 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TXNL1O43396 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TXNL1O43396 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TXNL1O43396 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TXNL1O43396 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TXNL1O43396 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TXNL1O43396 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TXNL1O43396 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TXNL1O43396 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TXNL1O43396 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TXNL1O43396 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TXNL1O43396 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TXNL1O43396 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TXNL1O43396 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TXNL1O43396 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TXNL1O43396 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TXNL1O43396 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TXNL1O43396 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TXNL1O43396 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TXNL1O43396 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TXNL1O43396 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TXNL1O43396 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TXNL1O43396 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TXNL1O43396 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TXNL1O43396 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TXNL1O43396 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TXNL1O43396 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TXNL1O43396 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.5 ms