Protein–RNA interactions for Protein: O43281

EFS, Embryonal Fyn-associated substrate, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFSO43281 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EFSO43281 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EFSO43281 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EFSO43281 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EFSO43281 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
EFSO43281 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EFSO43281 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
EFSO43281 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EFSO43281 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
EFSO43281 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EFSO43281 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EFSO43281 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EFSO43281 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EFSO43281 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EFSO43281 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EFSO43281 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EFSO43281 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EFSO43281 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EFSO43281 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EFSO43281 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EFSO43281 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EFSO43281 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EFSO43281 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EFSO43281 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EFSO43281 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EFSO43281 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EFSO43281 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EFSO43281 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EFSO43281 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EFSO43281 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EFSO43281 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
EFSO43281 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EFSO43281 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EFSO43281 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EFSO43281 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EFSO43281 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
EFSO43281 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EFSO43281 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EFSO43281 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EFSO43281 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EFSO43281 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EFSO43281 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EFSO43281 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EFSO43281 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
EFSO43281 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EFSO43281 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
EFSO43281 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EFSO43281 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EFSO43281 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EFSO43281 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EFSO43281 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EFSO43281 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EFSO43281 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EFSO43281 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EFSO43281 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EFSO43281 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
EFSO43281 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EFSO43281 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EFSO43281 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EFSO43281 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
EFSO43281 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
EFSO43281 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
EFSO43281 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EFSO43281 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EFSO43281 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EFSO43281 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EFSO43281 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EFSO43281 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EFSO43281 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EFSO43281 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EFSO43281 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EFSO43281 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EFSO43281 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EFSO43281 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EFSO43281 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EFSO43281 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EFSO43281 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EFSO43281 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EFSO43281 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EFSO43281 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EFSO43281 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EFSO43281 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EFSO43281 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EFSO43281 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EFSO43281 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EFSO43281 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EFSO43281 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EFSO43281 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EFSO43281 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
EFSO43281 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EFSO43281 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EFSO43281 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EFSO43281 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EFSO43281 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EFSO43281 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EFSO43281 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EFSO43281 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
EFSO43281 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EFSO43281 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EFSO43281 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms