Protein–RNA interactions for Protein: O43181

NDUFS4, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial, humanhuman

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Length 175 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS4O43181 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NDUFS4O43181 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NDUFS4O43181 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NDUFS4O43181 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NDUFS4O43181 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NDUFS4O43181 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NDUFS4O43181 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NDUFS4O43181 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NDUFS4O43181 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NDUFS4O43181 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NDUFS4O43181 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NDUFS4O43181 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
NDUFS4O43181 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
NDUFS4O43181 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NDUFS4O43181 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NDUFS4O43181 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NDUFS4O43181 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NDUFS4O43181 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NDUFS4O43181 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NDUFS4O43181 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NDUFS4O43181 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NDUFS4O43181 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NDUFS4O43181 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NDUFS4O43181 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NDUFS4O43181 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NDUFS4O43181 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NDUFS4O43181 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NDUFS4O43181 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NDUFS4O43181 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NDUFS4O43181 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NDUFS4O43181 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
NDUFS4O43181 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NDUFS4O43181 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NDUFS4O43181 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NDUFS4O43181 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NDUFS4O43181 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
NDUFS4O43181 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NDUFS4O43181 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NDUFS4O43181 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NDUFS4O43181 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NDUFS4O43181 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NDUFS4O43181 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NDUFS4O43181 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NDUFS4O43181 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NDUFS4O43181 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NDUFS4O43181 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NDUFS4O43181 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NDUFS4O43181 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NDUFS4O43181 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NDUFS4O43181 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NDUFS4O43181 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NDUFS4O43181 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NDUFS4O43181 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NDUFS4O43181 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NDUFS4O43181 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NDUFS4O43181 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NDUFS4O43181 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NDUFS4O43181 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NDUFS4O43181 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NDUFS4O43181 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NDUFS4O43181 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NDUFS4O43181 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NDUFS4O43181 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NDUFS4O43181 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NDUFS4O43181 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NDUFS4O43181 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NDUFS4O43181 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NDUFS4O43181 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NDUFS4O43181 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NDUFS4O43181 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NDUFS4O43181 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NDUFS4O43181 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NDUFS4O43181 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NDUFS4O43181 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NDUFS4O43181 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NDUFS4O43181 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NDUFS4O43181 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NDUFS4O43181 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NDUFS4O43181 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NDUFS4O43181 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NDUFS4O43181 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NDUFS4O43181 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NDUFS4O43181 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NDUFS4O43181 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NDUFS4O43181 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NDUFS4O43181 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NDUFS4O43181 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NDUFS4O43181 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
NDUFS4O43181 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NDUFS4O43181 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NDUFS4O43181 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
NDUFS4O43181 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NDUFS4O43181 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NDUFS4O43181 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NDUFS4O43181 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NDUFS4O43181 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NDUFS4O43181 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NDUFS4O43181 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NDUFS4O43181 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NDUFS4O43181 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
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