Protein–RNA interactions for Protein: O15111

CHUK, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHUKO15111 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CHUKO15111 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CHUKO15111 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CHUKO15111 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CHUKO15111 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CHUKO15111 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CHUKO15111 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CHUKO15111 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CHUKO15111 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CHUKO15111 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CHUKO15111 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CHUKO15111 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CHUKO15111 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CHUKO15111 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CHUKO15111 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CHUKO15111 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CHUKO15111 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CHUKO15111 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
CHUKO15111 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CHUKO15111 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CHUKO15111 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CHUKO15111 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CHUKO15111 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CHUKO15111 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CHUKO15111 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CHUKO15111 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CHUKO15111 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CHUKO15111 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CHUKO15111 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CHUKO15111 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CHUKO15111 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CHUKO15111 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CHUKO15111 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CHUKO15111 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CHUKO15111 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CHUKO15111 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CHUKO15111 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CHUKO15111 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CHUKO15111 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CHUKO15111 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CHUKO15111 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CHUKO15111 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CHUKO15111 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CHUKO15111 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CHUKO15111 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CHUKO15111 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CHUKO15111 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CHUKO15111 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CHUKO15111 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CHUKO15111 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CHUKO15111 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CHUKO15111 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CHUKO15111 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CHUKO15111 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CHUKO15111 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CHUKO15111 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CHUKO15111 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHUKO15111 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHUKO15111 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHUKO15111 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHUKO15111 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CHUKO15111 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHUKO15111 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHUKO15111 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHUKO15111 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHUKO15111 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHUKO15111 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHUKO15111 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHUKO15111 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHUKO15111 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHUKO15111 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHUKO15111 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHUKO15111 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHUKO15111 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHUKO15111 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHUKO15111 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CHUKO15111 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CHUKO15111 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CHUKO15111 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CHUKO15111 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHUKO15111 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHUKO15111 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHUKO15111 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHUKO15111 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHUKO15111 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHUKO15111 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHUKO15111 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHUKO15111 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHUKO15111 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHUKO15111 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHUKO15111 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHUKO15111 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHUKO15111 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHUKO15111 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHUKO15111 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHUKO15111 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHUKO15111 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHUKO15111 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHUKO15111 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHUKO15111 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms