Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 2,479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CEP290O15078 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CEP290O15078 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CEP290O15078 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CEP290O15078 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CEP290O15078 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CEP290O15078 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
CEP290O15078 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CEP290O15078 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CEP290O15078 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
CEP290O15078 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CEP290O15078 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CEP290O15078 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CEP290O15078 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CEP290O15078 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CEP290O15078 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
CEP290O15078 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
CEP290O15078 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CEP290O15078 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CEP290O15078 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CEP290O15078 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CEP290O15078 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CEP290O15078 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CEP290O15078 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CEP290O15078 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CEP290O15078 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CEP290O15078 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CEP290O15078 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CEP290O15078 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CEP290O15078 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CEP290O15078 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CEP290O15078 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
CEP290O15078 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CEP290O15078 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CEP290O15078 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CEP290O15078 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CEP290O15078 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CEP290O15078 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CEP290O15078 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
CEP290O15078 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CEP290O15078 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
CEP290O15078 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CEP290O15078 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
CEP290O15078 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CEP290O15078 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CEP290O15078 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CEP290O15078 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CEP290O15078 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CEP290O15078 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
CEP290O15078 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CEP290O15078 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CEP290O15078 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CEP290O15078 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CEP290O15078 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CEP290O15078 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CEP290O15078 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CEP290O15078 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CEP290O15078 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CEP290O15078 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CEP290O15078 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CEP290O15078 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CEP290O15078 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CEP290O15078 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CEP290O15078 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CEP290O15078 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CEP290O15078 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CEP290O15078 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CEP290O15078 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CEP290O15078 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CEP290O15078 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CEP290O15078 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CEP290O15078 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CEP290O15078 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CEP290O15078 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CEP290O15078 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CEP290O15078 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CEP290O15078 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CEP290O15078 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CEP290O15078 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CEP290O15078 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CEP290O15078 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
CEP290O15078 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CEP290O15078 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CEP290O15078 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CEP290O15078 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CEP290O15078 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CEP290O15078 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CEP290O15078 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CEP290O15078 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CEP290O15078 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CEP290O15078 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CEP290O15078 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CEP290O15078 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CEP290O15078 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CEP290O15078 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CEP290O15078 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CEP290O15078 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CEP290O15078 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
CEP290O15078 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CEP290O15078 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms