Protein–RNA interactions for Protein: O15016

TRIM66, Tripartite motif-containing protein 66, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM66O15016 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRIM66O15016 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRIM66O15016 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRIM66O15016 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRIM66O15016 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRIM66O15016 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRIM66O15016 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRIM66O15016 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRIM66O15016 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRIM66O15016 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRIM66O15016 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRIM66O15016 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRIM66O15016 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRIM66O15016 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRIM66O15016 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRIM66O15016 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRIM66O15016 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRIM66O15016 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
TRIM66O15016 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRIM66O15016 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRIM66O15016 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRIM66O15016 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRIM66O15016 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRIM66O15016 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
TRIM66O15016 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRIM66O15016 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
TRIM66O15016 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRIM66O15016 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRIM66O15016 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRIM66O15016 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRIM66O15016 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRIM66O15016 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRIM66O15016 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRIM66O15016 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRIM66O15016 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRIM66O15016 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRIM66O15016 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRIM66O15016 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
TRIM66O15016 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRIM66O15016 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRIM66O15016 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRIM66O15016 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRIM66O15016 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRIM66O15016 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRIM66O15016 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRIM66O15016 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRIM66O15016 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRIM66O15016 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRIM66O15016 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRIM66O15016 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
TRIM66O15016 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
TRIM66O15016 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
TRIM66O15016 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TRIM66O15016 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TRIM66O15016 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRIM66O15016 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRIM66O15016 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRIM66O15016 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRIM66O15016 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRIM66O15016 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRIM66O15016 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRIM66O15016 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRIM66O15016 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRIM66O15016 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRIM66O15016 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRIM66O15016 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRIM66O15016 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRIM66O15016 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRIM66O15016 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRIM66O15016 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRIM66O15016 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRIM66O15016 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRIM66O15016 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRIM66O15016 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRIM66O15016 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
TRIM66O15016 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRIM66O15016 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRIM66O15016 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRIM66O15016 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRIM66O15016 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRIM66O15016 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRIM66O15016 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRIM66O15016 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRIM66O15016 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRIM66O15016 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRIM66O15016 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRIM66O15016 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRIM66O15016 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
TRIM66O15016 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRIM66O15016 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRIM66O15016 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.56■■■□□ 2
TRIM66O15016 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
TRIM66O15016 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TRIM66O15016 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TRIM66O15016 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TRIM66O15016 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TRIM66O15016 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TRIM66O15016 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
TRIM66O15016 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TRIM66O15016 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms