Protein–RNA interactions for Protein: E9PQR5

NPIPB8, Nuclear pore complex-interacting protein family member B8, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB8E9PQR5 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NPIPB8E9PQR5 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
NPIPB8E9PQR5 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NPIPB8E9PQR5 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NPIPB8E9PQR5 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NPIPB8E9PQR5 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
NPIPB8E9PQR5 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NPIPB8E9PQR5 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NPIPB8E9PQR5 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NPIPB8E9PQR5 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NPIPB8E9PQR5 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NPIPB8E9PQR5 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NPIPB8E9PQR5 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NPIPB8E9PQR5 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NPIPB8E9PQR5 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NPIPB8E9PQR5 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NPIPB8E9PQR5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NPIPB8E9PQR5 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NPIPB8E9PQR5 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NPIPB8E9PQR5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NPIPB8E9PQR5 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NPIPB8E9PQR5 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NPIPB8E9PQR5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NPIPB8E9PQR5 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NPIPB8E9PQR5 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NPIPB8E9PQR5 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NPIPB8E9PQR5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NPIPB8E9PQR5 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NPIPB8E9PQR5 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NPIPB8E9PQR5 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NPIPB8E9PQR5 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NPIPB8E9PQR5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NPIPB8E9PQR5 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NPIPB8E9PQR5 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NPIPB8E9PQR5 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NPIPB8E9PQR5 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NPIPB8E9PQR5 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
NPIPB8E9PQR5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NPIPB8E9PQR5 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NPIPB8E9PQR5 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NPIPB8E9PQR5 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NPIPB8E9PQR5 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NPIPB8E9PQR5 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NPIPB8E9PQR5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NPIPB8E9PQR5 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NPIPB8E9PQR5 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NPIPB8E9PQR5 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NPIPB8E9PQR5 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NPIPB8E9PQR5 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NPIPB8E9PQR5 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NPIPB8E9PQR5 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NPIPB8E9PQR5 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NPIPB8E9PQR5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NPIPB8E9PQR5 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NPIPB8E9PQR5 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NPIPB8E9PQR5 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
NPIPB8E9PQR5 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NPIPB8E9PQR5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NPIPB8E9PQR5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NPIPB8E9PQR5 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NPIPB8E9PQR5 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NPIPB8E9PQR5 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NPIPB8E9PQR5 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NPIPB8E9PQR5 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NPIPB8E9PQR5 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NPIPB8E9PQR5 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NPIPB8E9PQR5 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NPIPB8E9PQR5 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NPIPB8E9PQR5 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NPIPB8E9PQR5 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NPIPB8E9PQR5 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
NPIPB8E9PQR5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NPIPB8E9PQR5 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NPIPB8E9PQR5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NPIPB8E9PQR5 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NPIPB8E9PQR5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NPIPB8E9PQR5 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NPIPB8E9PQR5 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NPIPB8E9PQR5 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NPIPB8E9PQR5 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NPIPB8E9PQR5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NPIPB8E9PQR5 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NPIPB8E9PQR5 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NPIPB8E9PQR5 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NPIPB8E9PQR5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NPIPB8E9PQR5 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NPIPB8E9PQR5 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NPIPB8E9PQR5 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NPIPB8E9PQR5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NPIPB8E9PQR5 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NPIPB8E9PQR5 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NPIPB8E9PQR5 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NPIPB8E9PQR5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NPIPB8E9PQR5 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
NPIPB8E9PQR5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NPIPB8E9PQR5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NPIPB8E9PQR5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NPIPB8E9PQR5 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NPIPB8E9PQR5 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NPIPB8E9PQR5 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms