Protein–RNA interactions for Protein: C9J366

IQCJ-SCHIP1, IQCJ-SCHIP1 readthrough, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IQCJ-SCHIP1C9J366 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
IQCJ-SCHIP1C9J366 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
IQCJ-SCHIP1C9J366 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
IQCJ-SCHIP1C9J366 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IQCJ-SCHIP1C9J366 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
IQCJ-SCHIP1C9J366 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
IQCJ-SCHIP1C9J366 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IQCJ-SCHIP1C9J366 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
IQCJ-SCHIP1C9J366 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
IQCJ-SCHIP1C9J366 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IQCJ-SCHIP1C9J366 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
IQCJ-SCHIP1C9J366 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IQCJ-SCHIP1C9J366 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IQCJ-SCHIP1C9J366 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IQCJ-SCHIP1C9J366 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
IQCJ-SCHIP1C9J366 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
IQCJ-SCHIP1C9J366 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IQCJ-SCHIP1C9J366 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
IQCJ-SCHIP1C9J366 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IQCJ-SCHIP1C9J366 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IQCJ-SCHIP1C9J366 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IQCJ-SCHIP1C9J366 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IQCJ-SCHIP1C9J366 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IQCJ-SCHIP1C9J366 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IQCJ-SCHIP1C9J366 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IQCJ-SCHIP1C9J366 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IQCJ-SCHIP1C9J366 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IQCJ-SCHIP1C9J366 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IQCJ-SCHIP1C9J366 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IQCJ-SCHIP1C9J366 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IQCJ-SCHIP1C9J366 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IQCJ-SCHIP1C9J366 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
IQCJ-SCHIP1C9J366 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IQCJ-SCHIP1C9J366 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IQCJ-SCHIP1C9J366 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
IQCJ-SCHIP1C9J366 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
IQCJ-SCHIP1C9J366 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
IQCJ-SCHIP1C9J366 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IQCJ-SCHIP1C9J366 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
IQCJ-SCHIP1C9J366 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
IQCJ-SCHIP1C9J366 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IQCJ-SCHIP1C9J366 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IQCJ-SCHIP1C9J366 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IQCJ-SCHIP1C9J366 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
IQCJ-SCHIP1C9J366 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
IQCJ-SCHIP1C9J366 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
IQCJ-SCHIP1C9J366 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
IQCJ-SCHIP1C9J366 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IQCJ-SCHIP1C9J366 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IQCJ-SCHIP1C9J366 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
IQCJ-SCHIP1C9J366 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
IQCJ-SCHIP1C9J366 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IQCJ-SCHIP1C9J366 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IQCJ-SCHIP1C9J366 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
IQCJ-SCHIP1C9J366 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
IQCJ-SCHIP1C9J366 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
IQCJ-SCHIP1C9J366 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
IQCJ-SCHIP1C9J366 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
IQCJ-SCHIP1C9J366 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IQCJ-SCHIP1C9J366 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
IQCJ-SCHIP1C9J366 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IQCJ-SCHIP1C9J366 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
IQCJ-SCHIP1C9J366 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
IQCJ-SCHIP1C9J366 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
IQCJ-SCHIP1C9J366 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
IQCJ-SCHIP1C9J366 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
IQCJ-SCHIP1C9J366 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IQCJ-SCHIP1C9J366 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
IQCJ-SCHIP1C9J366 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
IQCJ-SCHIP1C9J366 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IQCJ-SCHIP1C9J366 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IQCJ-SCHIP1C9J366 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IQCJ-SCHIP1C9J366 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
IQCJ-SCHIP1C9J366 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
IQCJ-SCHIP1C9J366 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IQCJ-SCHIP1C9J366 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IQCJ-SCHIP1C9J366 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IQCJ-SCHIP1C9J366 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
IQCJ-SCHIP1C9J366 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IQCJ-SCHIP1C9J366 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
IQCJ-SCHIP1C9J366 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
IQCJ-SCHIP1C9J366 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
IQCJ-SCHIP1C9J366 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
IQCJ-SCHIP1C9J366 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
IQCJ-SCHIP1C9J366 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
IQCJ-SCHIP1C9J366 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
IQCJ-SCHIP1C9J366 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
IQCJ-SCHIP1C9J366 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
IQCJ-SCHIP1C9J366 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
IQCJ-SCHIP1C9J366 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
IQCJ-SCHIP1C9J366 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
IQCJ-SCHIP1C9J366 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
IQCJ-SCHIP1C9J366 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms