Protein–RNA interactions for Protein: A6NKB5

PCNX2, Pecanex-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 2,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX2A6NKB5 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PCNX2A6NKB5 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PCNX2A6NKB5 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PCNX2A6NKB5 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCNX2A6NKB5 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PCNX2A6NKB5 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCNX2A6NKB5 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCNX2A6NKB5 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCNX2A6NKB5 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCNX2A6NKB5 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCNX2A6NKB5 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PCNX2A6NKB5 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PCNX2A6NKB5 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PCNX2A6NKB5 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PCNX2A6NKB5 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCNX2A6NKB5 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCNX2A6NKB5 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCNX2A6NKB5 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCNX2A6NKB5 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PCNX2A6NKB5 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PCNX2A6NKB5 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PCNX2A6NKB5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PCNX2A6NKB5 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PCNX2A6NKB5 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PCNX2A6NKB5 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCNX2A6NKB5 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCNX2A6NKB5 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCNX2A6NKB5 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCNX2A6NKB5 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCNX2A6NKB5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCNX2A6NKB5 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PCNX2A6NKB5 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PCNX2A6NKB5 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PCNX2A6NKB5 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCNX2A6NKB5 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCNX2A6NKB5 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PCNX2A6NKB5 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PCNX2A6NKB5 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PCNX2A6NKB5 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PCNX2A6NKB5 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PCNX2A6NKB5 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCNX2A6NKB5 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCNX2A6NKB5 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCNX2A6NKB5 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCNX2A6NKB5 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCNX2A6NKB5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCNX2A6NKB5 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCNX2A6NKB5 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCNX2A6NKB5 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCNX2A6NKB5 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCNX2A6NKB5 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCNX2A6NKB5 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCNX2A6NKB5 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCNX2A6NKB5 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCNX2A6NKB5 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCNX2A6NKB5 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCNX2A6NKB5 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCNX2A6NKB5 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCNX2A6NKB5 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PCNX2A6NKB5 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCNX2A6NKB5 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCNX2A6NKB5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCNX2A6NKB5 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCNX2A6NKB5 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCNX2A6NKB5 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCNX2A6NKB5 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCNX2A6NKB5 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PCNX2A6NKB5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCNX2A6NKB5 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCNX2A6NKB5 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCNX2A6NKB5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCNX2A6NKB5 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCNX2A6NKB5 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCNX2A6NKB5 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCNX2A6NKB5 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCNX2A6NKB5 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCNX2A6NKB5 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCNX2A6NKB5 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PCNX2A6NKB5 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PCNX2A6NKB5 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PCNX2A6NKB5 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PCNX2A6NKB5 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCNX2A6NKB5 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCNX2A6NKB5 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCNX2A6NKB5 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCNX2A6NKB5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCNX2A6NKB5 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCNX2A6NKB5 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCNX2A6NKB5 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCNX2A6NKB5 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCNX2A6NKB5 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCNX2A6NKB5 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCNX2A6NKB5 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCNX2A6NKB5 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCNX2A6NKB5 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCNX2A6NKB5 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCNX2A6NKB5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCNX2A6NKB5 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PCNX2A6NKB5 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PCNX2A6NKB5 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 185.4 ms