Protein–RNA interactions for Protein: A6NK06

ACOD1, Cis-aconitate decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACOD1A6NK06 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACOD1A6NK06 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACOD1A6NK06 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACOD1A6NK06 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACOD1A6NK06 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACOD1A6NK06 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACOD1A6NK06 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACOD1A6NK06 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACOD1A6NK06 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACOD1A6NK06 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACOD1A6NK06 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACOD1A6NK06 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACOD1A6NK06 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACOD1A6NK06 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ACOD1A6NK06 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACOD1A6NK06 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACOD1A6NK06 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACOD1A6NK06 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACOD1A6NK06 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACOD1A6NK06 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACOD1A6NK06 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ACOD1A6NK06 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACOD1A6NK06 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACOD1A6NK06 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACOD1A6NK06 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ACOD1A6NK06 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACOD1A6NK06 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACOD1A6NK06 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACOD1A6NK06 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACOD1A6NK06 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACOD1A6NK06 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACOD1A6NK06 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ACOD1A6NK06 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACOD1A6NK06 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACOD1A6NK06 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACOD1A6NK06 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACOD1A6NK06 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACOD1A6NK06 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACOD1A6NK06 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACOD1A6NK06 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACOD1A6NK06 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACOD1A6NK06 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
ACOD1A6NK06 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACOD1A6NK06 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACOD1A6NK06 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACOD1A6NK06 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACOD1A6NK06 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACOD1A6NK06 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACOD1A6NK06 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACOD1A6NK06 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACOD1A6NK06 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACOD1A6NK06 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACOD1A6NK06 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACOD1A6NK06 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACOD1A6NK06 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACOD1A6NK06 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACOD1A6NK06 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACOD1A6NK06 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACOD1A6NK06 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACOD1A6NK06 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACOD1A6NK06 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACOD1A6NK06 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACOD1A6NK06 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACOD1A6NK06 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACOD1A6NK06 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACOD1A6NK06 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACOD1A6NK06 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACOD1A6NK06 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACOD1A6NK06 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACOD1A6NK06 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACOD1A6NK06 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ACOD1A6NK06 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACOD1A6NK06 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACOD1A6NK06 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACOD1A6NK06 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACOD1A6NK06 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACOD1A6NK06 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACOD1A6NK06 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACOD1A6NK06 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACOD1A6NK06 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACOD1A6NK06 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACOD1A6NK06 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACOD1A6NK06 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACOD1A6NK06 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACOD1A6NK06 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACOD1A6NK06 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACOD1A6NK06 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACOD1A6NK06 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACOD1A6NK06 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACOD1A6NK06 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACOD1A6NK06 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACOD1A6NK06 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACOD1A6NK06 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACOD1A6NK06 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACOD1A6NK06 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACOD1A6NK06 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACOD1A6NK06 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACOD1A6NK06 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACOD1A6NK06 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACOD1A6NK06 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms