Protein–RNA interactions for Protein: A4D1U4

LCHN, Protein LCHN, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCHNA4D1U4 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LCHNA4D1U4 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
LCHNA4D1U4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
LCHNA4D1U4 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LCHNA4D1U4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LCHNA4D1U4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LCHNA4D1U4 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LCHNA4D1U4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
LCHNA4D1U4 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
LCHNA4D1U4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LCHNA4D1U4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LCHNA4D1U4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LCHNA4D1U4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LCHNA4D1U4 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LCHNA4D1U4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
LCHNA4D1U4 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LCHNA4D1U4 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
LCHNA4D1U4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
LCHNA4D1U4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LCHNA4D1U4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
LCHNA4D1U4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LCHNA4D1U4 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LCHNA4D1U4 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LCHNA4D1U4 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LCHNA4D1U4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LCHNA4D1U4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LCHNA4D1U4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
LCHNA4D1U4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LCHNA4D1U4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LCHNA4D1U4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LCHNA4D1U4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LCHNA4D1U4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LCHNA4D1U4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LCHNA4D1U4 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LCHNA4D1U4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LCHNA4D1U4 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LCHNA4D1U4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
LCHNA4D1U4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
LCHNA4D1U4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
LCHNA4D1U4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
LCHNA4D1U4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
LCHNA4D1U4 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LCHNA4D1U4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LCHNA4D1U4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LCHNA4D1U4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LCHNA4D1U4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LCHNA4D1U4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LCHNA4D1U4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LCHNA4D1U4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
LCHNA4D1U4 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LCHNA4D1U4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LCHNA4D1U4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LCHNA4D1U4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
LCHNA4D1U4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LCHNA4D1U4 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
LCHNA4D1U4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LCHNA4D1U4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LCHNA4D1U4 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LCHNA4D1U4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LCHNA4D1U4 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LCHNA4D1U4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LCHNA4D1U4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LCHNA4D1U4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LCHNA4D1U4 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
LCHNA4D1U4 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LCHNA4D1U4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LCHNA4D1U4 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LCHNA4D1U4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LCHNA4D1U4 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LCHNA4D1U4 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LCHNA4D1U4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
LCHNA4D1U4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LCHNA4D1U4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LCHNA4D1U4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LCHNA4D1U4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LCHNA4D1U4 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LCHNA4D1U4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LCHNA4D1U4 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
LCHNA4D1U4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LCHNA4D1U4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LCHNA4D1U4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LCHNA4D1U4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LCHNA4D1U4 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LCHNA4D1U4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LCHNA4D1U4 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LCHNA4D1U4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LCHNA4D1U4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LCHNA4D1U4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
LCHNA4D1U4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LCHNA4D1U4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LCHNA4D1U4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LCHNA4D1U4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LCHNA4D1U4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LCHNA4D1U4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LCHNA4D1U4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LCHNA4D1U4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LCHNA4D1U4 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LCHNA4D1U4 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LCHNA4D1U4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LCHNA4D1U4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.7 ms