Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GVQ3

LINC00854, Long intergenic non-protein coding RNA 854, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00854A0A1B0GVQ3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LINC00854A0A1B0GVQ3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LINC00854A0A1B0GVQ3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LINC00854A0A1B0GVQ3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LINC00854A0A1B0GVQ3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LINC00854A0A1B0GVQ3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LINC00854A0A1B0GVQ3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LINC00854A0A1B0GVQ3 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LINC00854A0A1B0GVQ3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
LINC00854A0A1B0GVQ3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LINC00854A0A1B0GVQ3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LINC00854A0A1B0GVQ3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LINC00854A0A1B0GVQ3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LINC00854A0A1B0GVQ3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LINC00854A0A1B0GVQ3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LINC00854A0A1B0GVQ3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LINC00854A0A1B0GVQ3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LINC00854A0A1B0GVQ3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LINC00854A0A1B0GVQ3 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LINC00854A0A1B0GVQ3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LINC00854A0A1B0GVQ3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LINC00854A0A1B0GVQ3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LINC00854A0A1B0GVQ3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LINC00854A0A1B0GVQ3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LINC00854A0A1B0GVQ3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LINC00854A0A1B0GVQ3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LINC00854A0A1B0GVQ3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LINC00854A0A1B0GVQ3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LINC00854A0A1B0GVQ3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LINC00854A0A1B0GVQ3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LINC00854A0A1B0GVQ3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LINC00854A0A1B0GVQ3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LINC00854A0A1B0GVQ3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LINC00854A0A1B0GVQ3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LINC00854A0A1B0GVQ3 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LINC00854A0A1B0GVQ3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LINC00854A0A1B0GVQ3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LINC00854A0A1B0GVQ3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LINC00854A0A1B0GVQ3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LINC00854A0A1B0GVQ3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LINC00854A0A1B0GVQ3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LINC00854A0A1B0GVQ3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LINC00854A0A1B0GVQ3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LINC00854A0A1B0GVQ3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LINC00854A0A1B0GVQ3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LINC00854A0A1B0GVQ3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LINC00854A0A1B0GVQ3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LINC00854A0A1B0GVQ3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LINC00854A0A1B0GVQ3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LINC00854A0A1B0GVQ3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LINC00854A0A1B0GVQ3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LINC00854A0A1B0GVQ3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LINC00854A0A1B0GVQ3 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LINC00854A0A1B0GVQ3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LINC00854A0A1B0GVQ3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LINC00854A0A1B0GVQ3 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LINC00854A0A1B0GVQ3 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LINC00854A0A1B0GVQ3 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LINC00854A0A1B0GVQ3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LINC00854A0A1B0GVQ3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LINC00854A0A1B0GVQ3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LINC00854A0A1B0GVQ3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LINC00854A0A1B0GVQ3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LINC00854A0A1B0GVQ3 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LINC00854A0A1B0GVQ3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LINC00854A0A1B0GVQ3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LINC00854A0A1B0GVQ3 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LINC00854A0A1B0GVQ3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LINC00854A0A1B0GVQ3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
LINC00854A0A1B0GVQ3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LINC00854A0A1B0GVQ3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LINC00854A0A1B0GVQ3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LINC00854A0A1B0GVQ3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LINC00854A0A1B0GVQ3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LINC00854A0A1B0GVQ3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LINC00854A0A1B0GVQ3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LINC00854A0A1B0GVQ3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LINC00854A0A1B0GVQ3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LINC00854A0A1B0GVQ3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LINC00854A0A1B0GVQ3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LINC00854A0A1B0GVQ3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LINC00854A0A1B0GVQ3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LINC00854A0A1B0GVQ3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LINC00854A0A1B0GVQ3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LINC00854A0A1B0GVQ3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LINC00854A0A1B0GVQ3 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LINC00854A0A1B0GVQ3 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LINC00854A0A1B0GVQ3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LINC00854A0A1B0GVQ3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LINC00854A0A1B0GVQ3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
LINC00854A0A1B0GVQ3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LINC00854A0A1B0GVQ3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LINC00854A0A1B0GVQ3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LINC00854A0A1B0GVQ3 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LINC00854A0A1B0GVQ3 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LINC00854A0A1B0GVQ3 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LINC00854A0A1B0GVQ3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LINC00854A0A1B0GVQ3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
LINC00854A0A1B0GVQ3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LINC00854A0A1B0GVQ3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms