Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 GAS7-204ENST00000437099 8003 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
PTPRMP28827 DAPL1-201ENST00000309950 552 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
PTPRMP28827 MRPS6P2-201ENST00000381143 370 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
PTPRMP28827 DAPL1-203ENST00000409042 544 ntTSL 4 BASIC9.96□□□□□ -0.82
PTPRMP28827 GNG12-AS1-202ENST00000414904 796 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
PTPRMP28827 AC068481.1-201ENST00000415520 530 ntTSL 4 BASIC9.96□□□□□ -0.82
PTPRMP28827 AL137071.1-201ENST00000422150 243 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
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PTPRMP28827 OR2L9P-201ENST00000444456 913 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
PTPRMP28827 HMGN1P36-201ENST00000446623 298 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
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PTPRMP28827 OSMR-AS1-201ENST00000506463 800 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
PTPRMP28827 NDUFB5P1-201ENST00000508134 564 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
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PTPRMP28827 AL138900.3-201ENST00000607010 629 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
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PTPRMP28827 AC129778.1-202ENST00000623812 261 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
PTPRMP28827 AL591379.1-207ENST00000635982 261 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
PTPRMP28827 AMYH02020865.1-205ENST00000636189 261 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
PTPRMP28827 SAMMSON-214ENST00000641395 1264 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
PTPRMP28827 PPIP5K2-202ENST00000358359 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
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PTPRMP28827 HAT1-201ENST00000264108 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
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PTPRMP28827 FXR1-202ENST00000357559 8711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
PTPRMP28827 MGC15885-201ENST00000558940 2425 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
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PTPRMP28827 ADAMTS4-202ENST00000367996 9773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
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PTPRMP28827 CAP1-206ENST00000372805 2217 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PTPRMP28827 RAD51AP2-201ENST00000399080 3724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PTPRMP28827 SPATA31D5P-201ENST00000376459 4784 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
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PTPRMP28827 RBFOX1-203ENST00000355637 3321 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PTPRMP28827 SP110-203ENST00000358662 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PTPRMP28827 SRFBP1-201ENST00000339397 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PTPRMP28827 EPS15L1-214ENST00000602009 3915 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
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