Protein–RNA interactions for Protein: P29375

KDM5A, Lysine-specific demethylase 5A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5AP29375 DUBR-202ENST00000466734 2737 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
KDM5AP29375 SYT1-212ENST00000552744 2718 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
KDM5AP29375 RNA5SP279-201ENST00000365513 117 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
KDM5AP29375 IGLV3-16-201ENST00000390311 385 ntAPPRIS P1 BASIC9.87□□□□□ -0.83
KDM5AP29375 AL713923.1-201ENST00000414071 378 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
KDM5AP29375 LINC01506-201ENST00000432148 495 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
KDM5AP29375 RPL5P7-201ENST00000444235 813 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
KDM5AP29375 PRDX1P1-201ENST00000449329 596 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
KDM5AP29375 PPIAP20-201ENST00000449839 135 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
KDM5AP29375 DDI2-202ENST00000480945 10625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
KDM5AP29375 AC108063.1-201ENST00000513586 414 ntTSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
KDM5AP29375 LINC02457-201ENST00000552992 596 ntTSL 4 BASIC9.87□□□□□ -0.83
KDM5AP29375 AL445383.1-201ENST00000554689 874 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
KDM5AP29375 AC245052.7-201ENST00000601161 359 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
KDM5AP29375 AL035410.2-201ENST00000604963 864 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
KDM5AP29375 AC027559.1-201ENST00000636288 271 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
KDM5AP29375 AC008467.1-201ENST00000512693 5471 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
KDM5AP29375 VNN3-202ENST00000367927 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
KDM5AP29375 NAV2-213ENST00000533917 5084 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
KDM5AP29375 C8orf34-208ENST00000523686 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
KDM5AP29375 SOS2-202ENST00000543680 3960 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
KDM5AP29375 CYP2C18-201ENST00000285979 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
KDM5AP29375 LINC01060-204ENST00000510832 2435 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
KDM5AP29375 NLRC4-204ENST00000404025 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
KDM5AP29375 ATP2B1-204ENST00000428670 7032 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
KDM5AP29375 TMEM230-204ENST00000379277 1536 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
KDM5AP29375 PPARG-204ENST00000397000 1122 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
KDM5AP29375 MYL12B-202ENST00000400175 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
KDM5AP29375 AL035422.1-201ENST00000414193 397 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
KDM5AP29375 LINC02522-201ENST00000431401 256 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
KDM5AP29375 C1orf140-201ENST00000434398 645 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
KDM5AP29375 GAPDHP33-201ENST00000443168 1013 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
KDM5AP29375 GLRXP3-201ENST00000470810 321 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
KDM5AP29375 SEC62-AS1-201ENST00000479626 346 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
KDM5AP29375 UGT2A3P7-201ENST00000510485 734 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
KDM5AP29375 AL671883.2-201ENST00000539514 536 ntTSL 4 BASIC9.86□□□□□ -0.83
KDM5AP29375 IFNG-AS1-203ENST00000541715 902 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
KDM5AP29375 RACGAP1-216ENST00000548961 387 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
KDM5AP29375 AC008764.3-201ENST00000597357 432 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
KDM5AP29375 AC027243.2-201ENST00000602530 724 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
KDM5AP29375 SNORD96A-201ENST00000606577 79 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
KDM5AP29375 AC004448.4-210ENST00000610229 833 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
KDM5AP29375 AC239809.3-203ENST00000611286 1050 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
KDM5AP29375 uc_338.31-201ENST00000615595 186 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
KDM5AP29375 MBL2-201ENST00000373968 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
KDM5AP29375 FTO-222ENST00000637969 2889 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
KDM5AP29375 TDRKH-201ENST00000368822 3093 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
KDM5AP29375 SETD5-204ENST00000406341 6582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
KDM5AP29375 ERICH3-202ENST00000420661 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
KDM5AP29375 LIMCH1-202ENST00000381753 5705 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
KDM5AP29375 CCDC129-203ENST00000409210 3773 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KDM5AP29375 BCLAF3-203ENST00000379687 6528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KDM5AP29375 ROR1-AS1-201ENST00000412349 1574 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
KDM5AP29375 OR1C1-201ENST00000408896 1307 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KDM5AP29375 PSMC1P4-201ENST00000515236 1327 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
KDM5AP29375 RNA5SP321-201ENST00000362722 111 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
KDM5AP29375 HEATR1-201ENST00000366579 793 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KDM5AP29375 AC009229.2-201ENST00000417213 351 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KDM5AP29375 FABP5P1-201ENST00000423401 411 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
KDM5AP29375 CLEC19A-204ENST00000493231 557 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KDM5AP29375 AC112484.3-201ENST00000505910 329 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
KDM5AP29375 AC091868.2-201ENST00000506717 556 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KDM5AP29375 CSNK1A1-207ENST00000515768 1098 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KDM5AP29375 AC103718.1-201ENST00000522667 683 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KDM5AP29375 AP001831.1-201ENST00000524610 411 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KDM5AP29375 AL133399.1-201ENST00000527476 298 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
KDM5AP29375 AC016526.1-201ENST00000555465 520 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KDM5AP29375 AC145350.2-201ENST00000561541 821 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KDM5AP29375 AC012146.2-201ENST00000576545 416 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
KDM5AP29375 AC092070.2-201ENST00000597550 545 ntTSL 4 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KDM5AP29375 AL590032.1-201ENST00000604920 252 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
KDM5AP29375 AC093635.1-201ENST00000609028 555 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
KDM5AP29375 Metazoa_SRP.129-201ENST00000619776 251 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
KDM5AP29375 OR2AK2-202ENST00000641852 1008 ntAPPRIS P2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KDM5AP29375 ZMYND8-207ENST00000396281 5511 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KDM5AP29375 FAM49B-226ENST00000523509 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
KDM5AP29375 CD46-201ENST00000322875 3278 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
KDM5AP29375 CD46-207ENST00000367041 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
KDM5AP29375 ATP7B-206ENST00000448424 6404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
KDM5AP29375 AC104662.2-201ENST00000512921 1388 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KDM5AP29375 PCDH15-226ENST00000613657 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KDM5AP29375 HCG18-240ENST00000454269 2430 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KDM5AP29375 AC009690.2-201ENST00000570175 3148 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
KDM5AP29375 TTC28-208ENST00000612946 11274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
KDM5AP29375 BDNF-201ENST00000314915 4340 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
KDM5AP29375 CLEC1A-204ENST00000457018 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
KDM5AP29375 DLEU2L-201ENST00000371086 3555 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
KDM5AP29375 NPIPB13-201ENST00000520915 3584 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
KDM5AP29375 CDC7-203ENST00000428239 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
KDM5AP29375 TINAG-202ENST00000370864 692 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
KDM5AP29375 RBBP4P4-201ENST00000398588 1289 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
KDM5AP29375 RPL24P7-201ENST00000399435 453 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
KDM5AP29375 AC092687.1-201ENST00000418835 389 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
KDM5AP29375 AC114755.4-201ENST00000439114 443 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
KDM5AP29375 RPS27P20-201ENST00000492051 246 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
KDM5AP29375 RPL24-206ENST00000495401 478 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
KDM5AP29375 PFN2-217ENST00000498307 556 ntTSL 4 BASIC9.84□□□□□ -0.83
KDM5AP29375 AC023794.2-201ENST00000504891 528 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
KDM5AP29375 AL049836.2-201ENST00000553318 513 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
KDM5AP29375 AC011498.1-203ENST00000589066 359 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.7 ms