Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 MTIF3-203ENST00000405591 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
COG3Q96JB2 AC099670.1-201ENST00000455141 783 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
COG3Q96JB2 RN7SL870P-201ENST00000460111 296 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
COG3Q96JB2 AC117394.1-201ENST00000477323 567 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
COG3Q96JB2 RN7SL37P-201ENST00000490461 307 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
COG3Q96JB2 PFN2-217ENST00000498307 556 ntTSL 4 BASIC9.39□□□□□ -0.91
COG3Q96JB2 AC022126.1-201ENST00000502995 593 ntTSL 4 BASIC9.39□□□□□ -0.91
COG3Q96JB2 AC084026.1-201ENST00000522028 564 ntTSL 4 BASIC9.39□□□□□ -0.91
COG3Q96JB2 RPL27A-211ENST00000532359 406 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
COG3Q96JB2 SETP17-201ENST00000534163 817 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
COG3Q96JB2 AC025419.1-204ENST00000539653 745 ntTSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
COG3Q96JB2 NXPE2P1-201ENST00000543705 726 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
COG3Q96JB2 GNG2-203ENST00000553432 577 ntTSL 4 BASIC9.39□□□□□ -0.91
COG3Q96JB2 DIMT1P1-201ENST00000603970 763 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
COG3Q96JB2 AC004448.4-210ENST00000610229 833 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
COG3Q96JB2 MIR6503-201ENST00000622884 86 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
COG3Q96JB2 AL161457.2-202ENST00000629161 743 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
COG3Q96JB2 INTS7-202ENST00000366993 3422 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
COG3Q96JB2 CACNA1D-211ENST00000636570 6441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
COG3Q96JB2 ADI1-202ENST00000382093 3870 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
COG3Q96JB2 AP000866.1-202ENST00000529392 2792 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
COG3Q96JB2 MAMDC2-AS1-202ENST00000414515 2097 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
COG3Q96JB2 PKIA-AS1-202ENST00000522302 2011 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
COG3Q96JB2 CD109-201ENST00000287097 9130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
COG3Q96JB2 BRD8-201ENST00000230901 3198 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
COG3Q96JB2 BRCA1-221ENST00000493795 5732 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
COG3Q96JB2 NALCN-202ENST00000376200 1126 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
COG3Q96JB2 RBBP4P4-201ENST00000398588 1289 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
COG3Q96JB2 FDPSP5-201ENST00000399474 1057 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
COG3Q96JB2 FOXP1-AS1-201ENST00000465742 700 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
COG3Q96JB2 ZNF286A-205ENST00000472486 827 ntTSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
COG3Q96JB2 AC004063.1-201ENST00000508358 547 ntTSL 4 BASIC9.38□□□□□ -0.91
COG3Q96JB2 AC010634.1-201ENST00000513925 540 ntTSL 3 BASIC9.38□□□□□ -0.91
COG3Q96JB2 CRYAB-207ENST00000527950 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
COG3Q96JB2 AC006305.3-201ENST00000590589 454 ntTSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
COG3Q96JB2 AC010326.3-201ENST00000597780 679 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
COG3Q96JB2 MAS1-201ENST00000252660 9841 ntAPPRIS P1 BASIC9.38□□□□□ -0.91
COG3Q96JB2 MLLT10-202ENST00000377059 4850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
COG3Q96JB2 DAZ3-201ENST00000315357 3277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
COG3Q96JB2 DAZ2-201ENST00000382294 3277 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
COG3Q96JB2 DAZ4-204ENST00000415508 3277 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
COG3Q96JB2 DZANK1-203ENST00000357236 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
COG3Q96JB2 ZNF540-206ENST00000589117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
COG3Q96JB2 CLUL1-201ENST00000338387 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
COG3Q96JB2 NR1H4-206ENST00000548884 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
COG3Q96JB2 MAGEB10-202ENST00000614159 1389 ntAPPRIS P1 BASIC9.37□□□□□ -0.91
COG3Q96JB2 CHURC1-203ENST00000549115 2629 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
COG3Q96JB2 CTNND1-231ENST00000532463 5749 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
COG3Q96JB2 CACNA1D-219ENST00000636938 6868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
COG3Q96JB2 ZFP90-201ENST00000398253 4384 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.37□□□□□ -0.91
COG3Q96JB2 FBXW7-201ENST00000263981 3743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
COG3Q96JB2 FANCL-201ENST00000233741 1683 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
COG3Q96JB2 FANCL-202ENST00000402135 1698 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
COG3Q96JB2 RNA5SP308-201ENST00000362532 115 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
COG3Q96JB2 AC019178.1-201ENST00000392337 440 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
COG3Q96JB2 RN7SKP38-201ENST00000410782 309 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
COG3Q96JB2 AL354989.1-201ENST00000448245 635 ntTSL 3 BASIC9.37□□□□□ -0.91
COG3Q96JB2 AC098818.1-201ENST00000478593 252 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
COG3Q96JB2 AC015524.1-201ENST00000491585 472 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
COG3Q96JB2 AC002401.2-201ENST00000511361 430 ntTSL 3 BASIC9.37□□□□□ -0.91
COG3Q96JB2 AC011396.2-201ENST00000515598 582 ntTSL 3 BASIC9.37□□□□□ -0.91
COG3Q96JB2 OR5BK1P-201ENST00000550421 823 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
COG3Q96JB2 AC136285.2-201ENST00000562873 378 ntTSL 3 BASIC9.37□□□□□ -0.91
COG3Q96JB2 AC015911.2-201ENST00000585536 396 ntTSL 3 BASIC9.37□□□□□ -0.91
COG3Q96JB2 AP005329.3-201ENST00000609924 686 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
COG3Q96JB2 AL513478.2-201ENST00000610400 988 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
COG3Q96JB2 AC241377.2-201ENST00000612313 553 ntTSL 4 BASIC9.37□□□□□ -0.91
COG3Q96JB2 AL121583.1-201ENST00000612444 682 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
COG3Q96JB2 MIR6823-201ENST00000622118 61 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
COG3Q96JB2 LHX9-201ENST00000367387 7836 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
COG3Q96JB2 OR1L8-202ENST00000641027 2024 ntAPPRIS P1 BASIC9.37□□□□□ -0.91
COG3Q96JB2 TTTY10-202ENST00000455084 1628 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
COG3Q96JB2 IL24-207ENST00000611909 1621 ntTSL 3 BASIC9.37□□□□□ -0.91
COG3Q96JB2 C11orf54-207ENST00000528288 4094 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
COG3Q96JB2 RUNX1T1-205ENST00000436581 7454 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
COG3Q96JB2 AL671511.1-201ENST00000425033 3458 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
COG3Q96JB2 PPP1R12B-216ENST00000608999 15248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
COG3Q96JB2 NPIPB5-205ENST00000424340 3801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
COG3Q96JB2 ZRANB1-201ENST00000359653 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
COG3Q96JB2 OR14A16-202ENST00000641093 1367 ntAPPRIS P1 BASIC9.37□□□□□ -0.91
COG3Q96JB2 SORBS1-204ENST00000361941 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
COG3Q96JB2 NT5C2-203ENST00000404739 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
COG3Q96JB2 NFX1-203ENST00000379540 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
COG3Q96JB2 AL355488.1-201ENST00000449169 2611 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
COG3Q96JB2 TTLL5-207ENST00000554510 2624 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
COG3Q96JB2 RSRC1-203ENST00000464171 2411 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
COG3Q96JB2 TMEM230-204ENST00000379277 1536 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
COG3Q96JB2 PDE8B-208ENST00000505283 3474 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
COG3Q96JB2 SIPA1L1-202ENST00000381232 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
COG3Q96JB2 AL121985.1-201ENST00000598917 1308 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
COG3Q96JB2 LRRC4C-202ENST00000527150 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
COG3Q96JB2 PLEKHM3-202ENST00000427836 9807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
COG3Q96JB2 MEPE-201ENST00000361056 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
COG3Q96JB2 LINC02073-201ENST00000588341 2845 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
COG3Q96JB2 THAP9-201ENST00000302236 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
COG3Q96JB2 UGT2B4-201ENST00000305107 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
COG3Q96JB2 HHLA3-201ENST00000359875 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
COG3Q96JB2 PPIAP26-201ENST00000377951 522 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
COG3Q96JB2 TRAV13-1-201ENST00000390436 360 ntAPPRIS P1 BASIC9.36□□□□□ -0.91
COG3Q96JB2 AP004243.1-202ENST00000398983 969 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.7 ms