Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 ARF4-209ENST00000496292 1467 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 AC073342.2-201ENST00000595842 1800 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 AHNAK2-201ENST00000333244 18254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 SPHKAP-201ENST00000344657 6804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 RGS20-207ENST00000522225 1559 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 TBCCD1-203ENST00000424280 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 IL2RA-203ENST00000379959 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 IARS-205ENST00000443024 4341 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 AIG1-209ENST00000629020 3636 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 CSDE1-205ENST00000438362 4167 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 GUSBP1-205ENST00000607545 4157 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 SRGAP3-213ENST00000618999 3929 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 GRIA2-204ENST00000393815 5260 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 AC007993.1-201ENST00000621298 2430 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 LRRC49-204ENST00000544974 6605 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 RNA5SP472-201ENST00000363868 119 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 RN7SKP254-201ENST00000410685 310 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 AC006547.2-201ENST00000412713 526 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 AL627308.2-201ENST00000420014 432 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 PPIL1P1-201ENST00000423936 499 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 HMGN1P6-201ENST00000438508 291 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 AL161626.1-201ENST00000441480 490 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 LAPTM4BP1-201ENST00000447781 690 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 LINC02556-201ENST00000450776 346 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 ZNF32-AS1-201ENST00000453284 434 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 RN7SL834P-201ENST00000461450 286 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 RN7SL314P-201ENST00000490735 292 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 AC055860.1-201ENST00000525523 688 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 AL161747.2-201ENST00000535893 472 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 NDUFA3P4-201ENST00000560814 250 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 UBE2CP4-201ENST00000561405 535 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 AC007785.3-202ENST00000601033 518 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 IFNA5-201ENST00000610521 987 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 AC026951.2-201ENST00000613847 241 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 KDM5DP1-201ENST00000622542 298 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 5_8S_rRNA.6-201ENST00000637374 152 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 RTN4-203ENST00000357376 4110 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 IL5RA-201ENST00000256452 2001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 SAMD3-203ENST00000437477 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 SORBS1-207ENST00000371239 2436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 CDH18-205ENST00000506372 2432 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 AC105105.2-201ENST00000590797 4521 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 KCNIP4-201ENST00000359001 2168 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 AMPD1-203ENST00000520113 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 CCDC186-203ENST00000369287 7245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 DTNA-226ENST00000596745 1508 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 LRRC37B-220ENST00000584368 2773 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 PDE4D-210ENST00000503258 2860 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 NCOR1-204ENST00000395851 7950 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 MEF2C-226ENST00000625674 4343 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 CNOT4-205ENST00000423368 3297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 SP110-201ENST00000258381 2426 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 LINC02249-202ENST00000562624 4260 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 ZNF415-204ENST00000594011 2630 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 GRIK1-202ENST00000389124 2712 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 ELOVL5-201ENST00000304434 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 LRRIQ3-201ENST00000354431 2849 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 MLLT10-217ENST00000631589 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 SORBS1-203ENST00000354106 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 TXNDC9-202ENST00000409434 1111 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 RN7SKP85-201ENST00000411349 318 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 VN1R66P-201ENST00000412929 916 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 LINC01687-201ENST00000416327 795 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 AC109638.1-201ENST00000417406 326 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 AL596451.1-201ENST00000419824 572 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 AC118470.1-201ENST00000419891 453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 OR5P4P-201ENST00000424698 917 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 GYG1P2-201ENST00000426437 1006 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 LINC02243-201ENST00000441841 961 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 RN7SL308P-201ENST00000464971 297 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 AL138787.2-201ENST00000466576 367 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 AC093668.1-201ENST00000514917 911 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
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RTL8BQ17RB0 C11orf70-202ENST00000526781 845 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 OR9L1P-201ENST00000529493 933 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 AP001257.1-201ENST00000533106 385 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 CSAG2-201ENST00000535353 237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 HPS5-207ENST00000537258 1275 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 AC078860.1-201ENST00000546601 527 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
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RTL8BQ17RB0 SNHG14-217ENST00000552781 552 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 OR4N2-203ENST00000557677 1008 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 PCAT29-202ENST00000558941 545 ntTSL 4 BASIC5.74□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 AL031846.1-201ENST00000560933 314 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 CMC2-213ENST00000565914 528 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 MIR4470-201ENST00000583453 72 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 BOLA2P1-201ENST00000584794 232 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 AC087575.1-201ENST00000585087 229 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 AC005154.6-201ENST00000598361 687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 AC008385.1-201ENST00000604421 355 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 AP001554.1-201ENST00000604533 376 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 IZUMO3-203ENST00000604921 743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 AC063962.1-201ENST00000608199 521 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 AC087893.2-201ENST00000623272 255 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 OR10G8-202ENST00000641224 1033 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 C1D-202ENST00000407324 1379 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 TPTE2P2-201ENST00000403471 1466 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 SGO1-AS1-205ENST00000634837 1677 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 PLD5-203ENST00000427495 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 FOXP2-201ENST00000350908 2638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
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