Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 BANF2-201ENST00000246090 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 CCR8-201ENST00000326306 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 ATXN3-201ENST00000340660 1205 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 RNA5SP263-201ENST00000363376 128 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 SNORA70.9-201ENST00000384370 135 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 CFAP70-204ENST00000394865 1222 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 SNX24-202ENST00000395451 1050 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 VN1R66P-201ENST00000412929 916 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 AC020983.1-201ENST00000417063 543 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 RPL7AP72-201ENST00000417266 768 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 DHRS9-203ENST00000421653 1044 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 SOX9-AS1-203ENST00000424417 576 ntTSL 4 BASIC7.16□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 AC013264.1-201ENST00000449346 455 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 AC114755.1-201ENST00000453101 868 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 CMAHP-203ENST00000458373 1101 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 AL035660.2-201ENST00000461248 556 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 SNHG12-207ENST00000475441 444 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 RN7SKP248-201ENST00000516278 305 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 LINC01288-201ENST00000519189 529 ntTSL 4 BASIC7.16□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 GSTM3-206ENST00000540225 678 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 AL591767.3-201ENST00000554632 525 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 AC103968.1-201ENST00000557841 573 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 AC012291.1-201ENST00000559666 429 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 AC007614.1-201ENST00000566607 309 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 RN7SL42P-201ENST00000579786 294 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 TTN-AS1-215ENST00000585451 949 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 AC005884.1-201ENST00000588604 429 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 BICRA-AS1-201ENST00000598376 547 ntTSL 4 BASIC7.16□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 AL356052.1-201ENST00000605764 376 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 AL590560.2-201ENST00000608430 732 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 Metazoa_SRP.192-201ENST00000616260 286 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 AC243830.2-201ENST00000618067 630 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 SPINK6-203ENST00000621437 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 AP001885.1-201ENST00000621658 558 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 AC018659.2-201ENST00000624690 715 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 PDAP1-205ENST00000626285 120 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 TTC38-207ENST00000629918 162 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 HCCAT5-202ENST00000642127 1029 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 GVINP1-201ENST00000526769 8438 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 DMD-222ENST00000474231 5209 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 TMPRSS15-201ENST00000284885 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 VIRMA-202ENST00000421249 3924 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 OR5AS1-202ENST00000641320 7860 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 HRG-201ENST00000232003 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 LINC02397-201ENST00000504409 10626 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 IARS-205ENST00000443024 4341 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 CD53-201ENST00000271324 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 YES1-203ENST00000577961 4554 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 HECTD4-211ENST00000550722 15450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 AC087258.1-203ENST00000545400 1629 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 Z98257.1-202ENST00000431027 2493 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 C16orf87-202ENST00000394806 6640 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 CDKL5-205ENST00000623535 12533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 RARB-204ENST00000458646 2590 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 HHLA2-201ENST00000357759 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 KCNJ2-201ENST00000243457 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 COMMD2-203ENST00000473414 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 TTLL5-217ENST00000556893 3071 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 STMN2-201ENST00000220876 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 MYPN-204ENST00000540630 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 KLHL2-202ENST00000421009 2452 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 ATP6V0E1-201ENST00000265093 773 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 C2orf80-201ENST00000341287 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 RN7SKP107-201ENST00000364157 290 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 FAM204BP-201ENST00000369171 701 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 IL36G-202ENST00000376489 989 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 GAGE12E-201ENST00000381698 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 RPL23A-203ENST00000394938 688 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 OR2W4P-201ENST00000406496 926 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 LINC01525-201ENST00000442182 511 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 AC244021.2-201ENST00000445260 529 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 AL139350.1-201ENST00000448825 408 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 AL451063.1-201ENST00000450164 1133 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 AC107029.1-201ENST00000484675 465 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 AC010230.1-201ENST00000514115 443 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 LINC00589-202ENST00000518623 938 ntTSL 4 BASIC7.15□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 AC103409.1-201ENST00000521199 564 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 AP000873.4-201ENST00000528133 905 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 AP000662.1-201ENST00000530952 487 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 ASB8-207ENST00000536953 923 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 AC004672.2-201ENST00000537181 574 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 OR4N3P-201ENST00000559395 818 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 AC009119.1-204ENST00000561599 564 ntTSL 4 BASIC7.15□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 LINC02180-201ENST00000566439 1010 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 AC005899.5-201ENST00000584721 552 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 LINC01028-201ENST00000586373 1045 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 AL137190.1-201ENST00000603288 282 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 AC114810.1-201ENST00000607415 473 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 EIF5P2-201ENST00000618904 1035 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 Metazoa_SRP.99-201ENST00000621370 254 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 AC135068.4-201ENST00000622949 925 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 RPL36AP21-202ENST00000639134 430 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 HLA-B-257ENST00000640094 147 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 EEF1A1P22-201ENST00000559385 1380 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
IFFO1Q0D2I5 DOCK11P1-201ENST00000553480 5932 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
IFFO1Q0D2I5 COG2-209ENST00000534989 2963 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.27
IFFO1Q0D2I5 CENPK-208ENST00000508421 1586 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.27
IFFO1Q0D2I5 MMP10-201ENST00000279441 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
IFFO1Q0D2I5 NUP210L-201ENST00000271854 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
IFFO1Q0D2I5 TMEM155-203ENST00000394396 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.27
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