Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 BX649601.1-201ENST00000608264 572 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 AC109587.1-213ENST00000610844 652 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 Metazoa_SRP.27-201ENST00000617573 258 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 HMGN2-210ENST00000619352 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 MED15P6-202ENST00000621415 787 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 METTL15-211ENST00000634762 718 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 OR8B2-202ENST00000641451 1056 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 RNF219-201ENST00000282003 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 DNAJC5G-202ENST00000402462 1904 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 NXT2-203ENST00000372106 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 THAP12P7-201ENST00000520248 2290 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 C5orf64-203ENST00000505642 2970 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 NXF2B-202ENST00000602195 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 NXF2-202ENST00000625106 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 OR2T6-202ENST00000641644 4670 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 BRCA1-201ENST00000352993 3668 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 MUC21-201ENST00000376296 3651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 SNW1-204ENST00000554775 1687 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 CORIN-207ENST00000505909 3018 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 ADAMTS9-201ENST00000295903 7060 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 AC015849.5-201ENST00000604907 5473 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 SLC36A2-201ENST00000335244 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 RAB11A-209ENST00000569896 1396 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 RBM5-AS1-201ENST00000630404 1386 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 CD40LG-201ENST00000370628 1720 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 AL139805.2-201ENST00000455305 2433 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 LIMCH1-219ENST00000514096 3543 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 LINC02208-201ENST00000506769 2803 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 CYP2C19-202ENST00000480405 1417 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
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PDCD1Q15116 UTY-216ENST00000624098 3636 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
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PDCD1Q15116 STK4-202ENST00000372806 6342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 LARGE-AS1-203ENST00000438159 2618 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 ALPK1-201ENST00000177648 4537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
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PDCD1Q15116 CTNND1-233ENST00000532787 5751 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
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PDCD1Q15116 CCL20-201ENST00000358813 800 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
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PDCD1Q15116 LEMD1-204ENST00000367153 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
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PDCD1Q15116 OR4A40P-201ENST00000533878 948 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 AP000462.1-201ENST00000535704 818 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 LINC01397-201ENST00000554808 579 ntTSL 4 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 AL132712.1-201ENST00000555967 582 ntTSL 4 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 AC104229.1-201ENST00000561364 255 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 RN7SL311P-201ENST00000579858 306 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 AC069061.2-201ENST00000580686 480 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 CBX3P2-202ENST00000583365 535 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
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PDCD1Q15116 MTRNR2L12-201ENST00000600213 1049 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 YTHDF2P1-201ENST00000604759 1271 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 AC012653.2-201ENST00000621880 420 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 AC068057.2-201ENST00000624047 895 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 LINC01206-228ENST00000628718 871 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 TMBIM6-202ENST00000395006 2598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 CTAGE1-201ENST00000391403 4313 ntAPPRIS P2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 OPALIN-203ENST00000393871 3545 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 C15orf41-214ENST00000569302 1325 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 CCR3-208ENST00000545097 1786 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
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