Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4C0

NRXN3, Neurexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN3Q9Y4C0 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NRXN3Q9Y4C0 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NRXN3Q9Y4C0 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NRXN3Q9Y4C0 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NRXN3Q9Y4C0 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NRXN3Q9Y4C0 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NRXN3Q9Y4C0 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NRXN3Q9Y4C0 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NRXN3Q9Y4C0 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NRXN3Q9Y4C0 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NRXN3Q9Y4C0 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
NRXN3Q9Y4C0 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NRXN3Q9Y4C0 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NRXN3Q9Y4C0 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
NRXN3Q9Y4C0 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
NRXN3Q9Y4C0 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NRXN3Q9Y4C0 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NRXN3Q9Y4C0 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NRXN3Q9Y4C0 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
NRXN3Q9Y4C0 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NRXN3Q9Y4C0 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NRXN3Q9Y4C0 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NRXN3Q9Y4C0 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NRXN3Q9Y4C0 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NRXN3Q9Y4C0 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NRXN3Q9Y4C0 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NRXN3Q9Y4C0 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NRXN3Q9Y4C0 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
NRXN3Q9Y4C0 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
NRXN3Q9Y4C0 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NRXN3Q9Y4C0 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NRXN3Q9Y4C0 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NRXN3Q9Y4C0 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NRXN3Q9Y4C0 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NRXN3Q9Y4C0 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NRXN3Q9Y4C0 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NRXN3Q9Y4C0 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NRXN3Q9Y4C0 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NRXN3Q9Y4C0 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NRXN3Q9Y4C0 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NRXN3Q9Y4C0 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NRXN3Q9Y4C0 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NRXN3Q9Y4C0 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NRXN3Q9Y4C0 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NRXN3Q9Y4C0 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NRXN3Q9Y4C0 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NRXN3Q9Y4C0 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
NRXN3Q9Y4C0 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
NRXN3Q9Y4C0 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
NRXN3Q9Y4C0 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
NRXN3Q9Y4C0 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
NRXN3Q9Y4C0 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NRXN3Q9Y4C0 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NRXN3Q9Y4C0 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NRXN3Q9Y4C0 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NRXN3Q9Y4C0 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NRXN3Q9Y4C0 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NRXN3Q9Y4C0 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NRXN3Q9Y4C0 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NRXN3Q9Y4C0 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NRXN3Q9Y4C0 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NRXN3Q9Y4C0 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NRXN3Q9Y4C0 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NRXN3Q9Y4C0 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NRXN3Q9Y4C0 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NRXN3Q9Y4C0 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NRXN3Q9Y4C0 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NRXN3Q9Y4C0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NRXN3Q9Y4C0 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NRXN3Q9Y4C0 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NRXN3Q9Y4C0 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NRXN3Q9Y4C0 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NRXN3Q9Y4C0 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NRXN3Q9Y4C0 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NRXN3Q9Y4C0 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NRXN3Q9Y4C0 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NRXN3Q9Y4C0 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NRXN3Q9Y4C0 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NRXN3Q9Y4C0 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NRXN3Q9Y4C0 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NRXN3Q9Y4C0 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NRXN3Q9Y4C0 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NRXN3Q9Y4C0 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NRXN3Q9Y4C0 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NRXN3Q9Y4C0 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NRXN3Q9Y4C0 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
NRXN3Q9Y4C0 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NRXN3Q9Y4C0 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NRXN3Q9Y4C0 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NRXN3Q9Y4C0 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NRXN3Q9Y4C0 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NRXN3Q9Y4C0 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NRXN3Q9Y4C0 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NRXN3Q9Y4C0 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NRXN3Q9Y4C0 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
NRXN3Q9Y4C0 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NRXN3Q9Y4C0 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NRXN3Q9Y4C0 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NRXN3Q9Y4C0 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
NRXN3Q9Y4C0 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms