Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y496

KIF3A, Kinesin-like protein KIF3A, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF3AQ9Y496 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
KIF3AQ9Y496 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KIF3AQ9Y496 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
KIF3AQ9Y496 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KIF3AQ9Y496 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
KIF3AQ9Y496 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
KIF3AQ9Y496 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KIF3AQ9Y496 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
KIF3AQ9Y496 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KIF3AQ9Y496 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KIF3AQ9Y496 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KIF3AQ9Y496 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KIF3AQ9Y496 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KIF3AQ9Y496 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KIF3AQ9Y496 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KIF3AQ9Y496 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KIF3AQ9Y496 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KIF3AQ9Y496 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
KIF3AQ9Y496 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KIF3AQ9Y496 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KIF3AQ9Y496 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KIF3AQ9Y496 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
KIF3AQ9Y496 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KIF3AQ9Y496 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KIF3AQ9Y496 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KIF3AQ9Y496 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KIF3AQ9Y496 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KIF3AQ9Y496 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KIF3AQ9Y496 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KIF3AQ9Y496 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KIF3AQ9Y496 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KIF3AQ9Y496 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KIF3AQ9Y496 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KIF3AQ9Y496 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KIF3AQ9Y496 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KIF3AQ9Y496 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KIF3AQ9Y496 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
KIF3AQ9Y496 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KIF3AQ9Y496 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KIF3AQ9Y496 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KIF3AQ9Y496 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KIF3AQ9Y496 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KIF3AQ9Y496 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KIF3AQ9Y496 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KIF3AQ9Y496 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KIF3AQ9Y496 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KIF3AQ9Y496 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KIF3AQ9Y496 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KIF3AQ9Y496 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KIF3AQ9Y496 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KIF3AQ9Y496 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KIF3AQ9Y496 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KIF3AQ9Y496 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KIF3AQ9Y496 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KIF3AQ9Y496 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KIF3AQ9Y496 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KIF3AQ9Y496 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KIF3AQ9Y496 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KIF3AQ9Y496 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KIF3AQ9Y496 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KIF3AQ9Y496 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KIF3AQ9Y496 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KIF3AQ9Y496 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KIF3AQ9Y496 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KIF3AQ9Y496 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KIF3AQ9Y496 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KIF3AQ9Y496 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
KIF3AQ9Y496 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KIF3AQ9Y496 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KIF3AQ9Y496 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KIF3AQ9Y496 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KIF3AQ9Y496 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KIF3AQ9Y496 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KIF3AQ9Y496 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KIF3AQ9Y496 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KIF3AQ9Y496 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KIF3AQ9Y496 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KIF3AQ9Y496 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KIF3AQ9Y496 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KIF3AQ9Y496 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KIF3AQ9Y496 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KIF3AQ9Y496 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KIF3AQ9Y496 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KIF3AQ9Y496 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
KIF3AQ9Y496 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KIF3AQ9Y496 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KIF3AQ9Y496 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KIF3AQ9Y496 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KIF3AQ9Y496 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KIF3AQ9Y496 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
KIF3AQ9Y496 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KIF3AQ9Y496 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KIF3AQ9Y496 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KIF3AQ9Y496 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KIF3AQ9Y496 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
KIF3AQ9Y496 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KIF3AQ9Y496 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KIF3AQ9Y496 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KIF3AQ9Y496 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
KIF3AQ9Y496 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms