Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3C4

TPRKB, EKC/KEOPS complex subunit TPRKB, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRKBQ9Y3C4 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TPRKBQ9Y3C4 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TPRKBQ9Y3C4 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TPRKBQ9Y3C4 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TPRKBQ9Y3C4 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TPRKBQ9Y3C4 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TPRKBQ9Y3C4 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TPRKBQ9Y3C4 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TPRKBQ9Y3C4 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TPRKBQ9Y3C4 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TPRKBQ9Y3C4 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TPRKBQ9Y3C4 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TPRKBQ9Y3C4 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TPRKBQ9Y3C4 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TPRKBQ9Y3C4 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TPRKBQ9Y3C4 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TPRKBQ9Y3C4 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TPRKBQ9Y3C4 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TPRKBQ9Y3C4 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TPRKBQ9Y3C4 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TPRKBQ9Y3C4 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TPRKBQ9Y3C4 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TPRKBQ9Y3C4 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TPRKBQ9Y3C4 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TPRKBQ9Y3C4 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TPRKBQ9Y3C4 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TPRKBQ9Y3C4 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TPRKBQ9Y3C4 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TPRKBQ9Y3C4 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TPRKBQ9Y3C4 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TPRKBQ9Y3C4 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TPRKBQ9Y3C4 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TPRKBQ9Y3C4 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TPRKBQ9Y3C4 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TPRKBQ9Y3C4 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TPRKBQ9Y3C4 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
TPRKBQ9Y3C4 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
TPRKBQ9Y3C4 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TPRKBQ9Y3C4 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TPRKBQ9Y3C4 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TPRKBQ9Y3C4 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TPRKBQ9Y3C4 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TPRKBQ9Y3C4 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TPRKBQ9Y3C4 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TPRKBQ9Y3C4 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TPRKBQ9Y3C4 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TPRKBQ9Y3C4 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TPRKBQ9Y3C4 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TPRKBQ9Y3C4 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TPRKBQ9Y3C4 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TPRKBQ9Y3C4 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TPRKBQ9Y3C4 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TPRKBQ9Y3C4 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TPRKBQ9Y3C4 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TPRKBQ9Y3C4 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TPRKBQ9Y3C4 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TPRKBQ9Y3C4 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TPRKBQ9Y3C4 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TPRKBQ9Y3C4 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TPRKBQ9Y3C4 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TPRKBQ9Y3C4 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TPRKBQ9Y3C4 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TPRKBQ9Y3C4 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TPRKBQ9Y3C4 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TPRKBQ9Y3C4 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TPRKBQ9Y3C4 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TPRKBQ9Y3C4 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TPRKBQ9Y3C4 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TPRKBQ9Y3C4 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TPRKBQ9Y3C4 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TPRKBQ9Y3C4 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TPRKBQ9Y3C4 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TPRKBQ9Y3C4 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TPRKBQ9Y3C4 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TPRKBQ9Y3C4 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TPRKBQ9Y3C4 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TPRKBQ9Y3C4 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TPRKBQ9Y3C4 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TPRKBQ9Y3C4 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TPRKBQ9Y3C4 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TPRKBQ9Y3C4 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TPRKBQ9Y3C4 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TPRKBQ9Y3C4 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TPRKBQ9Y3C4 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TPRKBQ9Y3C4 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TPRKBQ9Y3C4 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TPRKBQ9Y3C4 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TPRKBQ9Y3C4 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TPRKBQ9Y3C4 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TPRKBQ9Y3C4 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TPRKBQ9Y3C4 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TPRKBQ9Y3C4 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TPRKBQ9Y3C4 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TPRKBQ9Y3C4 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TPRKBQ9Y3C4 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TPRKBQ9Y3C4 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TPRKBQ9Y3C4 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TPRKBQ9Y3C4 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TPRKBQ9Y3C4 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TPRKBQ9Y3C4 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms