Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B6

EMC9, ER membrane protein complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMC9Q9Y3B6 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EMC9Q9Y3B6 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EMC9Q9Y3B6 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EMC9Q9Y3B6 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
EMC9Q9Y3B6 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EMC9Q9Y3B6 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
EMC9Q9Y3B6 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EMC9Q9Y3B6 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EMC9Q9Y3B6 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EMC9Q9Y3B6 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EMC9Q9Y3B6 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EMC9Q9Y3B6 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EMC9Q9Y3B6 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EMC9Q9Y3B6 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EMC9Q9Y3B6 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EMC9Q9Y3B6 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EMC9Q9Y3B6 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EMC9Q9Y3B6 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EMC9Q9Y3B6 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EMC9Q9Y3B6 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EMC9Q9Y3B6 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EMC9Q9Y3B6 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EMC9Q9Y3B6 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EMC9Q9Y3B6 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EMC9Q9Y3B6 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EMC9Q9Y3B6 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EMC9Q9Y3B6 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EMC9Q9Y3B6 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EMC9Q9Y3B6 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EMC9Q9Y3B6 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EMC9Q9Y3B6 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EMC9Q9Y3B6 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EMC9Q9Y3B6 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
EMC9Q9Y3B6 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EMC9Q9Y3B6 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EMC9Q9Y3B6 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EMC9Q9Y3B6 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EMC9Q9Y3B6 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
EMC9Q9Y3B6 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
EMC9Q9Y3B6 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
EMC9Q9Y3B6 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
EMC9Q9Y3B6 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
EMC9Q9Y3B6 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
EMC9Q9Y3B6 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
EMC9Q9Y3B6 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
EMC9Q9Y3B6 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
EMC9Q9Y3B6 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
EMC9Q9Y3B6 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EMC9Q9Y3B6 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EMC9Q9Y3B6 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EMC9Q9Y3B6 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EMC9Q9Y3B6 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EMC9Q9Y3B6 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EMC9Q9Y3B6 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EMC9Q9Y3B6 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EMC9Q9Y3B6 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EMC9Q9Y3B6 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EMC9Q9Y3B6 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
EMC9Q9Y3B6 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
EMC9Q9Y3B6 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EMC9Q9Y3B6 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EMC9Q9Y3B6 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EMC9Q9Y3B6 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
EMC9Q9Y3B6 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
EMC9Q9Y3B6 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EMC9Q9Y3B6 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EMC9Q9Y3B6 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EMC9Q9Y3B6 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EMC9Q9Y3B6 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EMC9Q9Y3B6 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EMC9Q9Y3B6 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EMC9Q9Y3B6 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
EMC9Q9Y3B6 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
EMC9Q9Y3B6 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
EMC9Q9Y3B6 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EMC9Q9Y3B6 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EMC9Q9Y3B6 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EMC9Q9Y3B6 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EMC9Q9Y3B6 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EMC9Q9Y3B6 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EMC9Q9Y3B6 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EMC9Q9Y3B6 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EMC9Q9Y3B6 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18■□□□□ 0.47
EMC9Q9Y3B6 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
EMC9Q9Y3B6 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EMC9Q9Y3B6 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EMC9Q9Y3B6 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
EMC9Q9Y3B6 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
EMC9Q9Y3B6 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
EMC9Q9Y3B6 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
EMC9Q9Y3B6 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
EMC9Q9Y3B6 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EMC9Q9Y3B6 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EMC9Q9Y3B6 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
EMC9Q9Y3B6 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
EMC9Q9Y3B6 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
EMC9Q9Y3B6 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EMC9Q9Y3B6 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EMC9Q9Y3B6 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EMC9Q9Y3B6 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms