Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y275

TNFSF13B, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13B, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF13BQ9Y275 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TNFSF13BQ9Y275 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TNFSF13BQ9Y275 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TNFSF13BQ9Y275 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TNFSF13BQ9Y275 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TNFSF13BQ9Y275 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TNFSF13BQ9Y275 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TNFSF13BQ9Y275 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TNFSF13BQ9Y275 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TNFSF13BQ9Y275 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TNFSF13BQ9Y275 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TNFSF13BQ9Y275 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TNFSF13BQ9Y275 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TNFSF13BQ9Y275 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TNFSF13BQ9Y275 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TNFSF13BQ9Y275 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TNFSF13BQ9Y275 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TNFSF13BQ9Y275 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TNFSF13BQ9Y275 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TNFSF13BQ9Y275 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TNFSF13BQ9Y275 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TNFSF13BQ9Y275 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TNFSF13BQ9Y275 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TNFSF13BQ9Y275 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TNFSF13BQ9Y275 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TNFSF13BQ9Y275 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TNFSF13BQ9Y275 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TNFSF13BQ9Y275 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TNFSF13BQ9Y275 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TNFSF13BQ9Y275 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TNFSF13BQ9Y275 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TNFSF13BQ9Y275 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TNFSF13BQ9Y275 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TNFSF13BQ9Y275 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TNFSF13BQ9Y275 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TNFSF13BQ9Y275 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TNFSF13BQ9Y275 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TNFSF13BQ9Y275 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TNFSF13BQ9Y275 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TNFSF13BQ9Y275 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TNFSF13BQ9Y275 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TNFSF13BQ9Y275 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TNFSF13BQ9Y275 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TNFSF13BQ9Y275 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TNFSF13BQ9Y275 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TNFSF13BQ9Y275 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TNFSF13BQ9Y275 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TNFSF13BQ9Y275 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TNFSF13BQ9Y275 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TNFSF13BQ9Y275 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TNFSF13BQ9Y275 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TNFSF13BQ9Y275 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TNFSF13BQ9Y275 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TNFSF13BQ9Y275 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TNFSF13BQ9Y275 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TNFSF13BQ9Y275 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TNFSF13BQ9Y275 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TNFSF13BQ9Y275 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TNFSF13BQ9Y275 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TNFSF13BQ9Y275 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TNFSF13BQ9Y275 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TNFSF13BQ9Y275 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TNFSF13BQ9Y275 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TNFSF13BQ9Y275 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TNFSF13BQ9Y275 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TNFSF13BQ9Y275 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TNFSF13BQ9Y275 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TNFSF13BQ9Y275 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TNFSF13BQ9Y275 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TNFSF13BQ9Y275 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TNFSF13BQ9Y275 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TNFSF13BQ9Y275 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TNFSF13BQ9Y275 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TNFSF13BQ9Y275 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TNFSF13BQ9Y275 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TNFSF13BQ9Y275 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TNFSF13BQ9Y275 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TNFSF13BQ9Y275 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TNFSF13BQ9Y275 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TNFSF13BQ9Y275 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TNFSF13BQ9Y275 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TNFSF13BQ9Y275 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TNFSF13BQ9Y275 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TNFSF13BQ9Y275 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TNFSF13BQ9Y275 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TNFSF13BQ9Y275 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TNFSF13BQ9Y275 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TNFSF13BQ9Y275 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TNFSF13BQ9Y275 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TNFSF13BQ9Y275 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TNFSF13BQ9Y275 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TNFSF13BQ9Y275 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TNFSF13BQ9Y275 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TNFSF13BQ9Y275 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TNFSF13BQ9Y275 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TNFSF13BQ9Y275 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TNFSF13BQ9Y275 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TNFSF13BQ9Y275 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TNFSF13BQ9Y275 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TNFSF13BQ9Y275 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms