Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y241

HIGD1A, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD1AQ9Y241 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HIGD1AQ9Y241 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HIGD1AQ9Y241 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HIGD1AQ9Y241 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HIGD1AQ9Y241 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HIGD1AQ9Y241 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HIGD1AQ9Y241 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HIGD1AQ9Y241 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HIGD1AQ9Y241 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HIGD1AQ9Y241 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms