Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPW5

AGTPBP1, Cytosolic carboxypeptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGTPBP1Q9UPW5 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
AGTPBP1Q9UPW5 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AGTPBP1Q9UPW5 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AGTPBP1Q9UPW5 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AGTPBP1Q9UPW5 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
AGTPBP1Q9UPW5 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
AGTPBP1Q9UPW5 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AGTPBP1Q9UPW5 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AGTPBP1Q9UPW5 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AGTPBP1Q9UPW5 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AGTPBP1Q9UPW5 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AGTPBP1Q9UPW5 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
AGTPBP1Q9UPW5 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AGTPBP1Q9UPW5 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
AGTPBP1Q9UPW5 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
AGTPBP1Q9UPW5 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AGTPBP1Q9UPW5 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
AGTPBP1Q9UPW5 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
AGTPBP1Q9UPW5 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
AGTPBP1Q9UPW5 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
AGTPBP1Q9UPW5 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AGTPBP1Q9UPW5 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AGTPBP1Q9UPW5 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
AGTPBP1Q9UPW5 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AGTPBP1Q9UPW5 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
AGTPBP1Q9UPW5 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
AGTPBP1Q9UPW5 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AGTPBP1Q9UPW5 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AGTPBP1Q9UPW5 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
AGTPBP1Q9UPW5 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
AGTPBP1Q9UPW5 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
AGTPBP1Q9UPW5 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
AGTPBP1Q9UPW5 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AGTPBP1Q9UPW5 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
AGTPBP1Q9UPW5 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
AGTPBP1Q9UPW5 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AGTPBP1Q9UPW5 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AGTPBP1Q9UPW5 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
AGTPBP1Q9UPW5 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
AGTPBP1Q9UPW5 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AGTPBP1Q9UPW5 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AGTPBP1Q9UPW5 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
AGTPBP1Q9UPW5 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AGTPBP1Q9UPW5 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AGTPBP1Q9UPW5 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AGTPBP1Q9UPW5 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AGTPBP1Q9UPW5 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AGTPBP1Q9UPW5 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
AGTPBP1Q9UPW5 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
AGTPBP1Q9UPW5 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AGTPBP1Q9UPW5 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
AGTPBP1Q9UPW5 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
AGTPBP1Q9UPW5 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
AGTPBP1Q9UPW5 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AGTPBP1Q9UPW5 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
AGTPBP1Q9UPW5 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AGTPBP1Q9UPW5 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
AGTPBP1Q9UPW5 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AGTPBP1Q9UPW5 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AGTPBP1Q9UPW5 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
AGTPBP1Q9UPW5 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AGTPBP1Q9UPW5 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AGTPBP1Q9UPW5 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AGTPBP1Q9UPW5 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AGTPBP1Q9UPW5 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AGTPBP1Q9UPW5 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AGTPBP1Q9UPW5 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AGTPBP1Q9UPW5 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AGTPBP1Q9UPW5 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AGTPBP1Q9UPW5 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AGTPBP1Q9UPW5 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AGTPBP1Q9UPW5 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AGTPBP1Q9UPW5 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AGTPBP1Q9UPW5 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AGTPBP1Q9UPW5 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AGTPBP1Q9UPW5 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AGTPBP1Q9UPW5 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AGTPBP1Q9UPW5 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AGTPBP1Q9UPW5 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AGTPBP1Q9UPW5 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AGTPBP1Q9UPW5 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AGTPBP1Q9UPW5 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AGTPBP1Q9UPW5 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AGTPBP1Q9UPW5 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AGTPBP1Q9UPW5 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
AGTPBP1Q9UPW5 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AGTPBP1Q9UPW5 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AGTPBP1Q9UPW5 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AGTPBP1Q9UPW5 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AGTPBP1Q9UPW5 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
AGTPBP1Q9UPW5 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AGTPBP1Q9UPW5 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AGTPBP1Q9UPW5 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AGTPBP1Q9UPW5 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AGTPBP1Q9UPW5 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AGTPBP1Q9UPW5 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AGTPBP1Q9UPW5 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AGTPBP1Q9UPW5 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AGTPBP1Q9UPW5 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AGTPBP1Q9UPW5 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms