Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PHF8Q9UPP1 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
PHF8Q9UPP1 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PHF8Q9UPP1 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PHF8Q9UPP1 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
PHF8Q9UPP1 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PHF8Q9UPP1 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PHF8Q9UPP1 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PHF8Q9UPP1 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PHF8Q9UPP1 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PHF8Q9UPP1 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PHF8Q9UPP1 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PHF8Q9UPP1 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PHF8Q9UPP1 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PHF8Q9UPP1 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PHF8Q9UPP1 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PHF8Q9UPP1 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PHF8Q9UPP1 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PHF8Q9UPP1 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PHF8Q9UPP1 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PHF8Q9UPP1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PHF8Q9UPP1 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PHF8Q9UPP1 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PHF8Q9UPP1 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PHF8Q9UPP1 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PHF8Q9UPP1 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PHF8Q9UPP1 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PHF8Q9UPP1 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PHF8Q9UPP1 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PHF8Q9UPP1 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PHF8Q9UPP1 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PHF8Q9UPP1 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PHF8Q9UPP1 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
PHF8Q9UPP1 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PHF8Q9UPP1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PHF8Q9UPP1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PHF8Q9UPP1 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PHF8Q9UPP1 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PHF8Q9UPP1 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
PHF8Q9UPP1 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PHF8Q9UPP1 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PHF8Q9UPP1 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PHF8Q9UPP1 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PHF8Q9UPP1 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
PHF8Q9UPP1 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PHF8Q9UPP1 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PHF8Q9UPP1 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PHF8Q9UPP1 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PHF8Q9UPP1 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
PHF8Q9UPP1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PHF8Q9UPP1 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PHF8Q9UPP1 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PHF8Q9UPP1 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PHF8Q9UPP1 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PHF8Q9UPP1 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PHF8Q9UPP1 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PHF8Q9UPP1 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PHF8Q9UPP1 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PHF8Q9UPP1 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
PHF8Q9UPP1 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PHF8Q9UPP1 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
PHF8Q9UPP1 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PHF8Q9UPP1 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PHF8Q9UPP1 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PHF8Q9UPP1 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PHF8Q9UPP1 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PHF8Q9UPP1 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PHF8Q9UPP1 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PHF8Q9UPP1 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PHF8Q9UPP1 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PHF8Q9UPP1 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PHF8Q9UPP1 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
PHF8Q9UPP1 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PHF8Q9UPP1 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PHF8Q9UPP1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PHF8Q9UPP1 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PHF8Q9UPP1 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PHF8Q9UPP1 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PHF8Q9UPP1 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
PHF8Q9UPP1 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PHF8Q9UPP1 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PHF8Q9UPP1 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PHF8Q9UPP1 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PHF8Q9UPP1 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PHF8Q9UPP1 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PHF8Q9UPP1 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
PHF8Q9UPP1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PHF8Q9UPP1 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PHF8Q9UPP1 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PHF8Q9UPP1 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PHF8Q9UPP1 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PHF8Q9UPP1 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PHF8Q9UPP1 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
PHF8Q9UPP1 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PHF8Q9UPP1 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PHF8Q9UPP1 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
PHF8Q9UPP1 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PHF8Q9UPP1 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PHF8Q9UPP1 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PHF8Q9UPP1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms